Rick Sanchez è uno scienziato geniale e nichilista che trascina il suo ansioso nipote, Morty Smith, in pericolose avventure interdimensionali. La madre di Morty, Beth, è la figlia di Rick e una chirurga equina alle prese con la sua identità, mentre suo padre, Jerry, è insicuro e spesso disapprova l'influenza di Rick. La dinamica familiare è tesa, specialmente dopo il recente divorzio di Beth e Jerry.

La stagione inizia con Rick che evade dalla prigione della Federazione Galattica, orchestrando il collasso dell'economia della Federazione e la distruzione della Cittadella dei Rick. Questo evento porta direttamente al divorzio di Beth e Jerry. Mentre Rick, Morty e Summer (la sorella di Morty, tormentata dall'angoscia) affrontano il divorzio, si imbarcano in varie scappatelle. Rick evita la terapia familiare trasformandosi in un cetriolo per sopravvivere a un'avventura nelle fogne. Più tardi, una visita alla Cittadella dei Rick, ora senza il suo Consiglio, rivela che Evil Morty è salito al potere, manipolando gli eventi per diventare Presidente. Beth affronta il suo passato in un mondo fantastico d'infanzia creato da Rick, rendendosi conto che la sua natura oscura e distruttiva rispecchia quella di suo padre.

Alla fine, Rick e il Presidente degli Stati Uniti si impegnano in un futile conflitto. Nel frattempo, Beth e Jerry si riconciliano, portando a Rick che accetta a malincuore Jerry di nuovo in famiglia, sacrificando la sua posizione dominante. La famiglia Smith sembra essere tornata alla sua disfunzionale normalità, ma Morty ruba segretamente la pistola spara-portali di Rick.

La stagione 3 di Rick and Morty copre gli episodi 1-10. Ecco tutto quello che è successo:

Stagione 3, Episodio 1: La Rickdemption di Rickshank - Rick, essendosi intenzionalmente lasciato catturare, manipola la Federazione Galattica e la Cittadella dei Rick, portando al collasso dell'economia della Federazione e alla distruzione della Cittadella. Orchesta tutto questo per vendicarsi di Jerry per averlo tradito. L'episodio si conclude con Beth che divorzia da Jerry, e Rick che rivela a Morty che il suo intero piano era quello di rimuovere Jerry dalla famiglia e assicurarsi il proprio dominio, il tutto mentre è ossessionato dalla salsa Szechuan.

Stagione 3, Episodio 2: Rickmancing the Stone - Rick, Morty e Summer viaggiano in una Terra post-apocalittica per elaborare il divorzio dei loro genitori. Summer abbraccia uno stile di vita nichilista, diventando il leader dei Death Stalkers dopo aver ucciso il loro precedente leader, mentre Morty usa un braccio potente e senziente per canalizzare la sua rabbia. Rick alla fine ruba il prezioso Isotopo 322, facendo sì che la terra desolata ritorni al suo stato precedente. L'episodio si conclude con Summer e Morty che tornano a casa, avendo trovato un modo per affrontare il loro turbamento emotivo.

Stagione 3, Episodio 3: Rick Cetriolo - Rick si trasforma in un cetriolo per evitare la terapia familiare. Dopo che un gatto lo spinge nella fogna, costruisce un esoscheletro di scarafaggio e poi una tuta da ratto per sopravvivere e fuggire. Si allea con Jaguar per fuggire da un complesso pesantemente sorvegliato, e al suo ritorno, Rick si scusa con Beth. L'episodio si conclude con Rick e Beth che decidono di andare a bere, ignorando il desiderio di Morty e Summer di fare più terapia.

Stagione 3, Episodio 4: Vindicators 3: Il Ritorno di Worldender - Dopo che un Rick ubriaco sconfigge il cattivo Worldender, organizza una serie di prove mortali in stile Saw per i Vindicators. La mattina seguente, un Rick con i postumi della sbornia costringe i Vindicators rimanenti a completare i suoi giochi perversi. Supernova uccide Million Ants, e l'episodio si conclude con una festa organizzata da Rick, dove il rapper Logic si esibisce, e i Vindicators vengono lasciati nello scompiglio.

Stagione 3, Episodio 5: La Cospirazione del Turbi-Giri - Rick porta Jerry in un resort intergalattico con un campo di immortalità, dove Jerry viene reclutato per assassinare Rick. Summer tenta di ingrandire il suo seno con la tecnologia di Rick, trasformandosi in un gigante, per poi essere rivoltata come un calzino da Beth. Rick e Jerry sopravvivono a un tentativo di assassinio sul Turbi-Giri, portando a Rick che uccide Risotto Groupon. L'episodio si conclude con Rick e Jerry che si separano, riconoscendo i loro ruoli nel divorzio di Beth e Jerry.

Stagione 3, Episodio 6: Riposo e Ricklaxation - Dopo una faticosa avventura, Rick e Morty visitano una spa che utilizza una macchina per estrarre i loro tratti negativi. Questo crea versioni senzienti "Tossiche" di loro stessi. Mentre le versioni "Pulite" diventano più premurose e sicure di sé, le controparti tossiche fuggono. Alla fine, Rick si rende conto di aver bisogno dei suoi difetti e forza una ri-fusione con il suo sé tossico, mentre Morty, ora un sociopatico sicuro di sé, sceglie di rimanere separato, perseguendo una vita come agente di borsa.

Stagione 3, Episodio 7: Il Mixup di Ricklantide - Questo episodio si concentra sulla Cittadella dei Rick dopo che Rick C-137 ha distrutto il suo Consiglio. Si sviluppano molteplici trame, tra cui un Rick e un Morty poliziotto che indagano su un crimine, Morty che si diplomano a scuola e un Morty candidato alla presidenza. L'episodio culmina con la rivelazione che il Candidato Morty è in realtà Evil Morty, che ha orchestrato la sua ascesa al potere. Morty poliziotto muore dopo aver ucciso Big Morty, e Rick poliziotto si arrende, lamentando la natura distruttiva dei Rick.

Stagione 3, Episodio 8: I Ricordi Cancellati di Morty - Dopo che Morty chiede che un ricordo traumatico venga cancellato, Rick rivela un deposito di ricordi dimenticati. Rick inizia a ripristinarli, portando a rivelazioni sempre più inquietanti, tra cui Morty che causa involontariamente il suicidio di un uomo innocente e la stessa follia di Rick che viene cancellata. Questo culmina con Rick e Morty che decidono di uccidersi, solo per essere salvati da Summer, che ripristina i loro ricordi.

Stagione 3, Episodio 9: L'ABC di Beth - Beth affronta il suo passato quando Rick rivela che il suo mondo immaginario d'infanzia, Froopyland, era una dimensione reale che lui ha creato. Lì, scopre che il suo amico d'infanzia Tommy è sopravvissuto impegnandosi in pratiche inquietanti. Beth lotta con la propria natura, rendendosi conto di essere notevolmente simile a Rick. L'episodio si conclude ambiguamente, con Beth che ha la possibilità di essere sostituita da un clone, lasciando la sua scelta finale non confermata.

Stagione 3, Episodio 10: Il Mortydate Manchuriano - Rick e Morty litigano con il Presidente degli Stati Uniti dopo aver completato una missione, portando a una battaglia di ego e distruzione di proprietà. Nel frattempo, Beth lotta con la sua identità, riconciliandosi infine con Jerry. Rick accetta a malincuore Jerry di nuovo in famiglia, sacrificando la propria posizione patriarcale. L'episodio si conclude con la famiglia Smith apparentemente tornata alla normalità, anche se Morty ha rubato la pistola portale di Rick.