Dexter Morgan jest analitykiem śladów krwi w Miami Metro, który potajemnie prowadzi podwójne życie jako seryjny morderca, polując na innych zabójców, którzy uniknęli sprawiedliwości. W tym sezonie Dexter przypadkowo zabija Oscara Prado, brata zastępcy prokuratora okręgowego Miguela Prado. To nieoczekiwane wydarzenie zmusza Dextera do niełatwego sojuszu z Miguelem, podczas gdy jego dziewczyna, Rita, ujawnia, że jest w ciąży, co dodaje znaczące nowe komplikacje do jego życia.

Gdy Dexter poluje na handlarza narkotyków Freebo, zostaje odkryty przez Miguela, który ku zaskoczeniu dziękuje Dexterowi za pomszczenie brata. Miguel staje się zafascynowany „mrocznym pasażerem” Dextera i chce uczestniczyć w jego samosądzie. Dexter próbuje nauczyć Miguela swojego kodeksu, ale prawdziwa natura Miguela wychodzi na jaw, gdy zaczyna zabijać poza zasadami Dextera, w szczególności mordując prawniczkę Ellen Wolf. To ujawnia manipulacyjne intencje Miguela, zamieniając ich sojusz w niebezpieczną grę w kotka i myszkę. Dexter zdaje sobie sprawę, że Miguel jest niebezpiecznym zagrożeniem i musi zostać powstrzymany.

Sezon kończy się konfrontacją Dextera i uduszeniem Miguela Prado, a za morderstwo zostaje wrobiony inny zabójca, George King (znany jako „Skinner”). Dexterowi udaje się następnie zabić George'a Kinga po tym, jak został schwytany i torturowany. Sezon kończy się ślubem Dextera z Ritą, pozornie przyjmującego normalne życie, choć kropla krwi na sukni ślubnej Rity wskazuje na jego trwałą ciemność.

Sezon 3 serialu Dexter obejmuje odcinki 1-12. Oto wszystko, co się wydarzyło:

Sezon 3, Odcinek 1: Nasz Ojciec - Dexter omyłkowo zabija Oscara Prado, brata zastępcy prokuratora okręgowego Miguela Prado, próbując zabić handlarza narkotyków. To nieplanowane zabójstwo prowadzi do zawiązania się przez Dextera niełatwego sojuszu z Miguelem. W międzyczasie Rita wyjawia Dexterowi, że jest w ciąży, co dodaje znaczącą nową komplikację do jego życia.

Sezon 3, Odcinek 2: Znalezienie Freebo - Dexter poluje na dealera narkotyków Freebo, który jest odpowiedzialny za śmierć Teegan. Dexter z powodzeniem zabija Freebo w wolnostojącym garażu, ale zostaje odkryty przez Miguela Prado. Dexter twierdzi, że działał w samoobronie, a Miguel, zaskakująco, dziękuje Dexterowi za pomszczenie śmierci brata. Odcinek kończy się, gdy Dexter pozbywa się ciała Freebo w oceanie, a Rita decyduje się zatrzymać dziecko.

Sezon 3, Odcinek 3: Lew Śpi Dziś - Dexter odkrywa pedofila, Nathana Martena, fotografującego Astor. Pomimo tego, że Marten nie pasuje do zwykłych kryteriów, Dexter dusi go na śmierć, mówiąc: "Nikt nie krzywdzi moich dzieci." Dexter zmaga się również z nadchodzącym ojcostwem. Odcinek kończy się, gdy Dexter przynosi mleko do domu Rity, kładzie rękę na jej brzuchu i akceptuje swoją rolę ojca.

Sezon 3, Odcinek 4: Wszystko w rodzinie - Dexter oświadcza się Ricie, która początkowo odmawia, ale ostatecznie się zgadza po tym, jak używa kwestii od zaburzonej kobiety, którą bada. Dexter manipuluje porywczym bratem Miguela, Ramonem, doprowadzając do agresywnej konfrontacji, co jeszcze bardziej izoluje Miguela i umacnia kontrolę Dextera. Ramon zostaje przedstawiony jako niestabilny i niewiarygodny, a Dexter z powodzeniem przekonuje Miguela, że jest jedyną osobą, na której może polegać.

Sezon 3, Odcinek 5: Zmiana w Bimini - Dexter śledzi męża, który zamordował dwie żony dla korzyści finansowych, do Bimini. W międzyczasie Rita doświadcza nagłego wypadku medycznego podczas USG, co powoduje, że Dexter przewartościowuje swoje priorytety. Manipulacja Miguela Prado "mrocznym pasażerem" Dextera nasila się, gdy Dexter zdaje sobie sprawę z prawdziwych intencji Miguela.

Sezon 3, Odcinek 6: Sí Se Puede - Dexter testuje zaangażowanie Miguela w jego mroczną ścieżkę, aranżując zabójstwo białego supremacjonisty, Clemsona Galta. W międzyczasie Debra podejrzewa, że Ramon Prado jest "Skinnerem", a Rita rozważa nową możliwość kariery. Odcinek kończy się Dexterem, któremu udaje się zabić Galta w pojedynkę, uświadamiając sobie, że Miguel nie jest jeszcze gotowy, by dzielić z nim zabójstwo, oraz Miguelem, który zdaje sobie sprawę, że Dexter go oszukał.

Sezon 3, Odcinek 7: Bułka z Masłem - Dexter jest rozdarty między swoim kodeksem a przyjaźniami. Z trudem godzi pragnienie Miguela, by zabić prawniczkę Ellen Wolf, ze swoimi własnymi zasadami. W międzyczasie, śmiertelnie chora przyjaciółka Dextera, Camilla, prosi go o zakończenie jej cierpienia. Dexter ostatecznie dokonuje eutanazji Camilli za pomocą zatrutego ciasta key lime, a ona umiera spokojnie, przyznając nawet, że Dexter miał rację zabijając swojego brata. Dexter i Miguel godzą się, a Miguel zostaje jego drużbą.

Sezon 3, Odcinek 8: Szkody, które może wyrządzić człowiek - Dexter niechętnie uczy Miguela Prado "Kodeksu", aby zabić Billy'ego Fleetera. Po tym, jak Dexter wstrzykuje Fleeterowi środek, Miguel dźga go nożem i zabija, uznając ten akt za ekscytujący. W międzyczasie Debra odkrywa, że jej informator i chłopak Anton zaginął, zdając sobie sprawę, że został porwany przez Skinnera. Dexter oświadcza się Ricie, wręczając jej pierścionek zaręczynowy.

Sezon 3, Odcinek 9: Ostatniej Nocy - Przyjaźń Dextera z Miguelem słabnie, gdy Rita konfrontuje go w sprawie podejrzewanej niewierności. Debra gorączkowo szuka Antona, który okazuje się być porwany przez "Skinnera". Dexter odkrywa, że Miguel zamordował Ellen Wolf, a badanie krwi potwierdza, że Miguel użył krowiej krwi, aby oszukać Dextera, ujawniając, że Miguel przez cały czas nim manipulował. Odcinek kończy się, gdy Dexter zdaje sobie sprawę, że Miguel jest niebezpiecznym zagrożeniem.

Sezon 3, Odcinek 10: Idź Własną Drogą - Napięty sojusz Dextera i Miguela osiąga punkt krytyczny, gdy angażują się w niebezpieczną grę w kotka i myszkę. Miguel grozi karierze Debry, aby manipulować Dexterem, podczas gdy Dexter rewanżuje się, ujawniając romans Miguela z LaGuertą jego żonie, Sylvii. Odcinek kulminuje się zasadzką i porwaniem Dextera, gdy ten rozważa swój następny ruch przeciwko Miguelowi.

Sezon 3, Odcinek 11: Miałem sen - Dexter zostaje niespodziewanie porwany na swój wieczór kawalerski, tylko po to, by zdać sobie sprawę, że musi teraz wyeliminować swojego drużbę, Miguela. LaGuerta zaczyna podejrzewać Miguela o udział w morderstwie Ellen Wolf, co prowadzi Dextera do zastawienia pułapki. Dexter konfrontuje się i dusi Miguela Prado na śmierć, wrobiając w morderstwo Skinnera. Debra dowiaduje się o romansie ojca z informatorką, a Dexter prosi ją, by została jego drużbą.

Sezon 3, Odcinek 12: Czy bierzesz Dextera Morgana? - Dexter przygotowuje się do ślubu z Ritą, jednocześnie radząc sobie z konsekwencjami śmierci Miguela i nowym zagrożeniem ze strony George'a Kinga. Dexterowi udaje się zabić George'a Kinga po tym, jak zostaje schwytany i torturowany. Odcinek kończy się ślubem Dextera i Rity, nieświadomych krwawej kropli spadającej z gipsu Dextera na suknię ślubną Rity, co zapowiada przyszłą ciemność.