Dexter Morgan est un expert en éclaboussures de sang pour la Miami Metro qui mène secrètement une double vie de tueur en série, traquant d'autres meurtriers ayant échappé à la justice. Cette saison, Dexter tue accidentellement Oscar Prado, le frère du procureur adjoint Miguel Prado. Cet événement inattendu force Dexter à une alliance difficile avec Miguel, tandis que sa petite amie, Rita, révèle qu'elle est enceinte, ajoutant une nouvelle complication significative à sa vie.

Alors que Dexter traque le trafiquant de drogue Freebo, il est découvert par Miguel, qui remercie étonnamment Dexter d'avoir vengé son frère. Miguel devient fasciné par le "passager noir" de Dexter et veut participer à sa justice de justicier. Dexter tente d'enseigner son code à Miguel, mais la vraie nature de Miguel émerge lorsqu'il commence à tuer en dehors des règles de Dexter, notamment en assassinant l'avocate Ellen Wolf. Cela révèle les intentions manipulatrices de Miguel, transformant leur alliance en un dangereux jeu du chat et de la souris. Dexter réalise que Miguel est une menace dangereuse et doit être arrêté.

La saison culmine avec Dexter confrontant et étranglant Miguel Prado à mort, faisant accuser un autre tueur, George King (connu sous le nom de "The Skinner"), du meurtre. Dexter parvient ensuite à tuer George King après avoir été capturé et torturé. La saison se termine avec Dexter épousant Rita, semblant embrasser une vie normale, bien qu'une goutte de sang sur la robe de mariée de Rita laisse entrevoir sa noirceur persistante.

La saison 3 de Dexter couvre les épisodes 1-12. Voici tout ce qui s'est passé:

Saison 3, Épisode 1 : Notre Père - Dexter tue accidentellement Oscar Prado, le frère du procureur adjoint Miguel Prado, alors qu'il tentait de tuer un trafiquant de drogue. Ce meurtre imprévu conduit Dexter à former une alliance fragile avec Miguel. Pendant ce temps, Rita révèle à Dexter qu'elle est enceinte, ajoutant une nouvelle complication importante à sa vie.

Saison 3, Épisode 2 : À la recherche de Freebo - Dexter traque le trafiquant de drogue Freebo, responsable de la mort de Teegan. Dexter réussit à tuer Freebo dans un garage isolé, mais est découvert par Miguel Prado. Dexter invoque la légitime défense, et Miguel, étonnamment, remercie Dexter d'avoir vengé la mort de son frère. L'épisode se termine avec Dexter se débarrassant du corps de Freebo dans l'océan, tandis que Rita décide de garder leur bébé.

Saison 3, Épisode 3 : Le lion dort ce soir - Dexter découvre un pédophile, Nathan Marten, photographiant Astor. Bien que Marten ne corresponde pas aux critères habituels, Dexter l'étrangle à mort, déclarant : « Personne ne fait de mal à mes enfants. » Dexter est également aux prises avec l'imminence de la paternité. L'épisode se termine avec Dexter apportant du lait chez Rita, posant une main sur son ventre et acceptant son rôle de père.

Saison 3, Épisode 4 : Une affaire de famille - Dexter demande Rita en mariage, qui refuse initialement mais finit par accepter après qu'il ait utilisé des répliques d'une femme perturbée sur laquelle il enquête. Dexter manipule Ramon, le frère instable de Miguel, pour qu'il ait une confrontation agressive, isolant davantage Miguel et consolidant le contrôle de Dexter. Ramon est présenté comme instable et peu fiable, et Dexter convainc avec succès Miguel qu'il est le seul sur qui il peut compter.

Saison 3, Épisode 5 : Virage Biminois - Dexter traque à Bimini un mari qui a assassiné deux épouses pour un gain financier. Pendant ce temps, Rita est victime d'une urgence médicale lors d'une échographie, ce qui amène Dexter à réévaluer ses priorités. La manipulation du "passager noir" de Dexter par Miguel Prado s'intensifie alors que Dexter réalise les véritables intentions de Miguel.

Saison 3, Épisode 6 : Sí Se Puede - Dexter teste l'engagement de Miguel envers son sombre chemin en s'arrangeant pour qu'ils tuent un suprémaciste blanc, Clemson Galt. Pendant ce temps, Debra soupçonne Ramon Prado d'être "L'Écorcheur", et Rita envisage une nouvelle opportunité de carrière. L'épisode se termine avec Dexter tuant Galt seul avec succès, réalisant que Miguel n'est pas encore prêt à partager son meurtre, et Miguel réalisant que Dexter l'a trompé.

Saison 3, Épisode 7 : Facile comme une tarte - Dexter est tiraillé entre son code et ses amitiés. Il a du mal à concilier le désir de Miguel de tuer l'avocate Ellen Wolf avec ses propres règles. Pendant ce temps, l'amie de Dexter, Camilla, atteinte d'une maladie en phase terminale, lui demande de mettre fin à ses souffrances. Dexter finit par euthanasier Camilla avec une tarte au citron vert empoisonnée, et elle meurt paisiblement, reconnaissant même que Dexter avait raison de tuer son frère. Dexter et Miguel se réconcilient, Miguel devenant son témoin.

Saison 3, Épisode 8 : Les dégâts qu'un homme peut causer - Dexter enseigne à contrecœur à Miguel Prado le "Code" pour tuer Billy Fleeter. Après que Dexter ait injecté Fleeter, Miguel le poignarde et le tue, trouvant l'acte exaltant. Pendant ce temps, Debra découvre que son petit ami informateur Anton a disparu, réalisant qu'il a été enlevé par le Skinner. Dexter demande Rita en mariage, lui offrant une bague de fiançailles.

Saison 3, Épisode 9 : À propos de la nuit dernière - L'amitié de Dexter avec Miguel s'effrite alors que Rita le confronte à propos d'une infidélité suspectée. Debra recherche frénétiquement Anton, qui s'avère avoir été enlevé par "Le Dépouilleur". Dexter découvre que Miguel a assassiné Ellen Wolf, et une analyse de sang confirme que Miguel a utilisé du sang de vache pour tromper Dexter, révélant que Miguel le manipule depuis le début. L'épisode se termine avec Dexter réalisant que Miguel est une menace dangereuse.

Saison 3, Épisode 10 : Fais ton propre chemin - L'alliance tendue entre Dexter et Miguel atteint un point de rupture alors qu'ils s'engagent dans un jeu dangereux du chat et de la souris. Miguel menace la carrière de Debra pour manipuler Dexter, tandis que Dexter riposte en exposant la liaison de Miguel avec LaGuerta à sa femme, Sylvia. L'épisode culmine avec Dexter pris en embuscade et enlevé alors qu'il envisage sa prochaine action contre Miguel.

Saison 3, Épisode 11 : J'ai fait un rêve - Dexter est enlevé de façon inattendue pour son enterrement de vie de garçon, pour se rendre compte qu'il doit maintenant éliminer son témoin, Miguel. LaGuerta se méfie de l'implication de Miguel dans le meurtre d'Ellen Wolf, ce qui amène Dexter à tendre un piège. Dexter confronte et étrangle Miguel Prado à mort, piégeant le Skinner pour le meurtre. Debra apprend la liaison de son père avec une informatrice, et Dexter lui demande d'être son témoin.

Saison 3, Épisode 12 : Épousez-vous Dexter Morgan ? - Dexter se prépare pour son mariage avec Rita tout en gérant les conséquences de la mort de Miguel et une nouvelle menace de George King. Dexter réussit à tuer George King après avoir été capturé et torturé. L'épisode se termine avec le mariage de Dexter et Rita, ignorant une goutte de sang tombant du plâtre de Dexter sur la robe de mariée de Rita, laissant présager de futures ténèbres.