Haven je misteriozni grad u kojem se redovno manifestuju natprirodne bolesti, poznate kao "Nevolje", izazivajući haos i opasnost. Agent FBI-ja Audrey Parker stiže u Haven i ubrzo otkriva da ima duboku, neobjašnjivu vezu sa gradom i njegovim ponavljajućim Nevoljama. Ona se udružuje sa lokalnim detektivom Nathanom Wuornosom, koji je imun na Nevolje, i često se sukobljava sa Dukeom Crockerom, šarmantnim krijumčarem čija je porodična loza prokleta Nevoljama. Audreyn primarni cilj je da razume svoj pravi identitet i misteriju "Colorado Kida", figure iz njene prošlosti, dok istovremeno pokušava da spreči Nevolje da unište Haven.

Ove sezone, Audrey saznaje šokantnu istinu: ona je figura koja se ponovo pojavljuje u Havenu svakih 27 godina kako bi zaustavila Nevolje, samo da bi nestala kada se dogodi nebeski događaj nazvan "Lovac". Potraga za Colorado Kidom se intenzivira kada se njegov grob pronađe prazan, što sugeriše da je možda još uvek živ. Nova pretnja se pojavljuje u obliku "Ubice sa pištoljem za vijke", koji cilja pojedince pogođene Nevoljama. Nathan i Duke su neočekivano poslati nazad u 1955. godinu, gde se Nathan zaljubljuje u "Sarah", raniji identitet Audrey. Kasnije, otkriva se da je Ubica sa pištoljem za vijke menjač kože po imenu Arla Cogan, žena Colorado Kida, koja manipuliše događajima kako bi naterala Audrey u misterioznu štalu.

Kako sezona kulminira, Audrey se suočava sa nemogućim izborom. Da bi okončala ciklus Nevolja koje muče Haven, mora ući u štalu, žrtva koja znači njen nestanak. Audrey ulazi u štalu, naizgled žrtvujući se da zaustavi Nevolje, a Duke nestaje u štali dok ona iščezava. Haven ostaje suočen sa uništenjem od nadolazeće meteorske oluje, ostavljajući Nathana samog usred haosa.

Sezona 3 serije Haven pokriva epizode od 1 do 13. Evo svega što se desilo:

Sezona 3, Epizoda 1: 301 - Audrey drži u zatočeništvu misteriozni čovek koji traži informacije o Koloradskom klincu. U međuvremenu, Haven muče bizarni vanzemaljski fenomeni, a sukob Nathana i Dukea eskalira. Grobnica Koloradskog klinca se ispostavlja praznom, a Audrey otkriva zagonetnu poruku sopstvenim rukopisom od pre 27 godina, koja sugeriše da Koloradski klinac možda još uvek živi.

Sezona 3, Epizoda 2: Ostani - Tajanstvena bolest uzrokuje da se ljudi pretvaraju u gole, ričuće muškarce. Odri i Natan istražuju, otkrivajući da su transformacije povezane sa farmerovim psom. Epizoda otkriva da je "Lovac" meteorološka oluja koja se javlja svakih 27 godina, a Odrijine prošle ličnosti nestaju tokom nje. Odri saznaje da joj je ostalo samo dva meseca do sledeće oluje.

Sezona 3, Epizoda 3: Farmer - Niz jezivih ubistava, gde su žrtvama izvađeni organi, dovodi Audrey i Nathana do problematične osobe iz lokalne klinike za plodnost. "Problem" ove osobe uzrokuje otkazivanje organa, primoravajući ga da ih uzima od članova porodice. Duke je primoran da ubije problematičnog čoveka, čime se prekida ciklus uzimanja organa. U međuvremenu, Audrey se bori sa svojim predstojećim nestankom zbog meteorske kiše Lovca.

Sezona 3, Epizoda 4: Preko glave - Dok misteriozna utapanja pogađaju Hejven, Odri istražuje niz smrti povezanih sa okeanom, sumnjajući na vezu sa nedostižnim Ubicom iz pištolja. U međuvremenu, Odri doživljava snažan flešbek na dan kada je Kolorado Kid umro, izazvan njenim medaljonom. Epizoda se završava tako što Odri i Djuk rade na lociranju Dafne, koja je zarobljena u automobilu dok se plima podiže, a Odri shvata da Dafna možda predstavlja vezu između žrtava.

Sezona 3, Epizoda 5: Dvostruka opasnost - Tajanstvena žena u belom počinje brutalno da napada kriminalce u Hevenu. Meta je Duke Crocker, a Audrey sumnja da je ova "žena u belom" povezana sa drugim nedavnim nasilnim zločinima. Epizoda se završava otkrićem da je napadač problematična osoba koja se može raspršiti u gips kada je povređena, a ubica sa pištoljem za eksere prikazan je kako šije delove tela, što implicira zastrašujuću novu kreaciju.

Sezona 3, Epizoda 6: Nekretnine - Namamljeni u zloglasnu ukletu kuću na Noć veštica, Odri, Natan, Djuk i ostali bivaju zarobljeni. Zlonamerni duh kuće, Roland Holovej, primorava ih da se suoče sa svojim strahovima i jedni s drugima. Čed je pronađen mrtav, a kasnije, Tina je nabodena, dok kuća manipuliše događajima, što na kraju dovodi do njenog uništenja bombom.

Sezona 3, Epizoda 7: Magic Hour (1) - Dok Odri i Djuk istražuju roditelje Kolorado klinca u Koloradu, Natan i Tomi se bave "problemom" u Hevenu gde se mrtvi vaskrsavaju za novac. Rika Hamilton je ubijena automobilom, samo da bi bila čudesno oživljena, ali onda je Noel upucana i ubijena od strane Tomija. Epizoda se završava tako što Odri pronalazi Natana naizgled mrtvog.

Sezona 3, Epizoda 8: Magični sat (2) - Odri i Djuk udružuju snage sa ubicom kojeg su lovili kako bi spasili Nejtona, koji je u kritičnom stanju. Trkaju se da pronađu ženu sa moći da oživi mrtve. U međuvremenu, Tejgovi otkrivaju da ih je Ubica iz Bolt Guna manipulisao i prate ubicu do njegove prave mete. Epizoda se završava Nejtanovim životom koji visi o koncu dok očajnički traže dodir vaskrsenja.

Sezona 3, Epizoda 9: Sarah - Duke i Nathan su vraćeni u 1955. godinu, gde Dukeove akcije da spase svog dedu nenamerno menjaju vremensku liniju. U prošlosti, Nathan razvija osećanja prema Sarah, ranijem identitetu Audrey. Epizoda se završava sa Sarah koja ubija Dukeovog dedu u samoodbrani, a Audrey shvata ozbiljne posledice njihovog vremenskog mešanja.

Sezona 3, Epizoda 10: Izgoreli - Audrey i Nathan istražuju izgorelo telo, samo da bi otkrili da je to Tommy, ali pravi Tommy je umro pre nekoliko nedelja. Susreću Ginger, devojku sa sposobnostima kontrole uma, koja otkriva manipulativne namere Straže. Ubica iz Bolt Guna otkriven je kao skin-voker, a Jordan pokušava da otme Ginger, što dovodi do njenog hapšenja. Epizoda se završava Audreyinim shvatanjem da mora da uđe u štalu da bi okončala Nedaće.

Sezona 3, Epizoda 11: Poslednji pozdravi - Odri se budi i zatiče ceo Hejven u dubokom snu, osim jednog čoveka koji pati od amnezije. Otkriva da je on nehotice izazvao komu u celom gradu kada je njegov strah od smrti aktivirao njegovu nevolju. Da bi spasao sve, mora biti vraćen u komu, što dovodi do njegove žrtve da okonča masovnu nesvesticu. Epizoda takođe otkriva da je Kler Kalahan bila koža koju je koristio Ubica iz pištolja.

Sezona 3, Epizoda 12: Ponovno okupljanje - Ubica cilja posetioce Nathanove proslave mature, vraćajući ih u tinejdžerske godine pre nego što ih ubije. Skinvoker se otkriva kao Arla Kogan, žena Kolorado Kida, koja traži Odrijinu pomoć da dođe do štale. Arlina prava istina i motiv su razotkriveni, i ona je uhapšena od strane braće Tig. Epizoda se završava tako što se Odri suočava sa neizbežnim dolaskom štale.

Sezona 3, Epizoda 13: Hvala na uspomenama - Dok oluja meteora preti Hevenu, Odri, Natan i Djuk suočavaju se sa Ubicom iz Bolt Gun-a i Odrinom neizbežnom sudbinom. Džejms Kogan, otkriven kao Natanov sin sa Sarom, dovodi Arla u štalu. Odri ulazi u štalu, žrtvujući sebe da bi okončala Nedaće, a Djuk nestaje u štali dok ona nestaje. Epizoda se završava sa Hevenom suočenim sa uništenjem od oluje meteora, ostavljajući Natana samog.