근미래, 플레이어들이 신경 장치인 '너브 기어'를 사용해 자신의 아바타를 조종하는 가상 현실 대규모 다중 사용자 온라인 롤플레잉 게임(VRMMORPG)인 '소드 아트 온라인'이 출시된다. 어느 날, 플레이어들은 로그아웃할 수 없다는 사실을 발견하게 되는데, 게임 제작자가 그들을 붙잡고 있으며, 게임의 타워 100층에 도달해 최종 보스를 처치해야만 풀려날 수 있다. 그러나 게임에서 죽으면 현실에서도 죽게 된다. 그들의 생존을 위한 투쟁이 지금 시작된다...