나루토는 숨겨진 잎 마을인 코노하의 주민들에게 두려움과 경멸의 대상이 되는 소년의 삶을 밀접하게 따라갑니다. 소년에 대한 불신은 그 자신과는 별개로, 그 안에 있는 것이 불안을 초래합니다. 나루토가 태어나기 훨씬 이전, 강력한 분노와 힘을 지닌 구미호(악마 여우)가 전쟁을 일으켜 많은 생명을 앗아갔습니다. 전투는 오랫동안 계속되었고, 코노하에서 가장 강력한 닌자, 4대 호카게인 욘다이메가 구미호와 치열하게 싸웠습니다. 결국 욘다이메는 악마를 인간의 몸에 봉인하여 승리를 거두었습니다. 그렇게 소년 나루토가 태어났습니다. 나루토는 성장하면서 자신이 사람들이 생각하는 것과는 다르며 사랑과 존경을 받을 만한 인간임을 보여주기 위해 코노하에서 가장 강력한 닌자가 되기로 결심합니다. 하지만 호카게, 즉 코노하에서 가장 강력한 닌자의 칭호를 얻기 위한 길은 길고 험난합니다. 그 길은 배신, 고통, 상실로 가득 차 있지만, 노력하면 나루토는 호카게가 될 수 있습니다.