Ingatan terawal Yuki adalah tentang malam badai di musim dingin, di mana ia diserang oleh vampir... Lalu diselamatkan oleh vampir lain. Kini 10 tahun kemudian, Yuki Cross, putri angkat kepala sekolah Akademi Cross, Kaien Cross, telah tumbuh dewasa dan menjadi penjaga ras vampir, melindungi pujaan hatinya sejak kecil, Kaname, agar tidak terungkap saat ia memimpin sekelompok vampir di sekolah asrama elit tersebut. Namun di sisinya juga ada Zero Kiryu, teman masa kecil yang kebenciannya terhadap makhluk yang menghancurkan segala sesuatu yang ia sayangi membuatnya bertekad untuk tidak pernah mempercayai mereka. Pengaturan hidup berdampingan ini tampaknya baik-baik saja, tetapi apakah para vampir benar-benar telah meninggalkan cara membunuh mereka, atau adakah kebenaran yang lebih gelap di balik tindakan mereka? Karena di dunia yang penuh rahasia ini, tidak ada yang seperti kelihatannya. Dan harga dari kepercayaan yang salah tempat bisa jadi lebih buruk daripada kematian.