"Hundred"—itulah satu-satunya senjata yang dapat melawan bentuk kehidupan misterius "Savage" yang mengancam bumi. Sang protagonis, Kirasagi Hayato, bercita-cita menjadi Master Seni Bela Diri menggunakan Hundred ini. Ia berhasil masuk ke universitas kapal perang Little Garden. Namun— "Aku ingin bertemu denganmu, Hayato!!!" "B-Bagaimana kau tahu namaku?" Di sekitar teman sekamarnya, Emil Crossford, yang entah bagaimana mengenalnya dengan baik (?), Hayato merasakan firasat yang tidak enak. Terlebih lagi, tak lama setelah upacara penerimaan, ia ditantang duel oleh master seni bela diri terkuat di kampus, "Queen" Claire Harvey...!? Pertarungan akademi pamungkas dimulai di sini!