Setelah pemboman yang menghancurkan di markas besar CIA, mantan Sersan Marinir Nicholas Brody dijebak sebagai dalang dan menjadi buronan. Petugas CIA Carrie Mathison, yang percaya pada ketidakbersalahan Brody meskipun menderita gangguan bipolar, dipermalukan di depan umum dan dikirim ke rumah sakit jiwa. Mentornya, Saul Berenson, Direktur CIA yang menjabat, tampaknya mengkhianatinya, mengungkapkan kondisinya dan perselingkuhannya di masa lalu dengan Brody kepada komite Senat. Namun, kehancuran publik ini adalah tipu muslihat yang diperhitungkan: Carrie dan Saul bekerja sama secara diam-diam untuk menarik keluar perwira intelijen Iran Majid Javadi.

Carrie dibebaskan dan mulai bekerja dengan pengacara Javadi, tampaknya melawan CIA, sebagai bagian dari rencana yang rumit. Sementara itu, Brody ditemukan dalam keadaan yang mengerikan di Caracas dan dipaksa oleh Saul untuk melakukan misi berbahaya di Iran. Tugasnya adalah membunuh Jenderal Akbari, seorang pejabat tinggi Iran, untuk memfasilitasi kebangkitan Javadi sebagai agen ganda untuk CIA. Brody berhasil melakukan pembunuhan itu, memukul dan mencekik Jenderal Akbari hingga tewas, dan menelepon Carrie untuk diekstraksi.

Meskipun berhasil, ekstraksi Brody digagalkan, dan dia ditangkap oleh pasukan Iran. Dia kemudian dieksekusi di depan umum di Iran. Empat bulan kemudian, Carrie, yang kini hamil anak Brody, ditempatkan di Istanbul dan diam-diam menambahkan bintang untuknya di dinding peringatan CIA.

Musim 3 dari Homeland mencakup episode 1-12. Berikut semua yang terjadi:

Musim 3, Episode 1: Tin Man is Down - Dua bulan setelah pengeboman CIA, Carrie diinterogasi oleh komite Senat sementara Saul memerintahkan pembunuhan enam dalang. Quinn ragu-ragu tetapi akhirnya secara tidak sengaja membunuh seorang anak selama misinya. Saul mengkhianati Carrie dengan mengungkapkan gangguan bipolar dan perselingkuhannya dengan Brody kepada komite. Episode berakhir dengan Carrie menyaksikan kesaksian Saul, hancur.

Musim 3, Episode 2: Uh... Oh... Ah... - Carrie secara sukarela dimasukkan ke rumah sakit jiwa setelah secara terbuka menyatakan Brody tidak bersalah. Saul merekrut Fara untuk melacak para pemodal serangan Langley. Quinn mengancam seorang bankir agar bekerja sama. Dana mencari pelipur lara bersama Leo. Dalam keadaan terbius berat, Carrie hanya bisa mengucapkan "Fuck you, Saul" saat dia mengunjunginya.

Musim 3, Episode 3: Tower of David - Brody ditahan di daerah kumuh Caracas, pulih dari luka tembak. Carrie dikurung di sebuah rumah sakit jiwa, mencoba meyakinkan terapisnya bahwa dia membaik. Brody mencari perlindungan di sebuah masjid, tetapi anak buah El Nino membunuh semua orang di sana kecuali Brody. Kembali di selnya, Brody menyuntikkan heroin. Episode berakhir dengan Brody dan Carrie di penjara masing-masing, menyerah pada narkoba.

Musim 3, Episode 4: Game On - Carrie dibebaskan dari rumah sakit jiwa dan, tanpa pilihan lain, tampaknya setuju untuk bekerja dengan pengacara Javadi, Bennett, melawan CIA. Dana kabur bersama Leo. Namun, episode ini berakhir dengan kejutan: Carrie dan Saul diam-diam bekerja sama, telah mengatur seluruh situasi untuk menarik teroris Iran.

Musim 3, Episode 5: The Yoga Play - Carrie membahayakan misinya untuk membantu Jessica menemukan Dana, melakukan "Yoga Play" yang berisiko untuk menghindari pengawasan. Saul mengetahui bahwa dia tidak akan menjadi Direktur CIA. Carrie diculik oleh anak buah Javadi. Dana menemukan rahasia gelap Leo tentang kematian yang tidak disengaja kakaknya dan kembali ke rumah. Episode berakhir dengan Javadi berhadapan dengan Carrie.

Musim 3, Episode 6: Masih Positif - Carrie menghadapi Javadi, mengungkapkan rencana CIA untuk menangkapnya. Carrie mengetahui bahwa dia hamil. Javadi, menghindari pertemuannya yang direncanakan dengan Saul, membunuh mantan istrinya Fariba dan menantunya Susan. Javadi ditangkap, dan Saul meninjunya setibanya di safehouse. Dana mengganti nama belakangnya menjadi Lazaro.

Musim 3, Episode 7: Gerontion - Saul meyakinkan Javadi untuk menjadi agen ganda di Iran, mengancam akan membongkar penggelapan uangnya. Quinn mengaku membunuh orang yang tidak dia bunuh untuk melindungi CIA. Javadi mengungkapkan kepada Carrie bahwa pelaku bom Langley yang sebenarnya masih buron. Lockhart terkunci di ruang konferensi. Episode berakhir dengan Carrie meminta bantuan Quinn untuk membersihkan nama Brody.

Musim 3, Episode 8: A Red Wheelbarrow - Carrie ditembak oleh Quinn saat mencoba mencegah Franklin membunuh pengebom Langley, yang kemudian dibunuh, menghilangkan saksi kunci atas ketidakbersalahan Brody. Sementara itu, Saul bersiap untuk perjalanan rahasia, dan Fara menghadapi pengawasan dari Inspektur Jenderal mengenai tindakannya. Episode berakhir dengan Saul menemukan Brody dalam keadaan yang mengerikan di Caracas.

Musim 3, Episode 9: Satu Hal Terakhir - Setelah penarikan heroin yang brutal, Brody dipaksa oleh Saul untuk melakukan misi berbahaya di Iran. Carrie memfasilitasi pertemuan singkat yang memilukan antara Brody dan putrinya yang terasing, Dana, yang menolaknya, menyatakan bahwa dia tidak ingin pernah melihatnya lagi. Brody kemudian berangkat ke Iran, bertekad untuk bertahan hidup demi Dana dan Carrie. Episode berakhir dengan Brody memulai misinya, menyiapkan panggung untuk penebusan atau kehancurannya.

Musim 3, Episode 10: Selamat Malam - Misi Brody untuk membunuh seorang pejabat Iran menjadi kacau ketika timnya disergap oleh polisi Kurdi. Setelah tim CIA melenyapkan para petugas, Brody melarikan diri dalam kepanikan tetapi akhirnya ditangkap oleh pasukan Iran. Majid Javadi mengeksekusi salah satu tentara Brody, dan Brody dibawa ke Teheran, sendirian dan di wilayah musuh.

Musim 3, Episode 11: Pria Besar di Teheran - Brody, yang berusaha memenuhi misinya, memukul dan mencekik Jenderal Akbari hingga tewas di kantornya. Dia kemudian menelepon Carrie, mengungkapkan tindakannya dan menuntut penjemputan. Sementara itu, Saul dan Lockhart mendiskusikan dugaan pembelotan Brody dan potensi Javadi sebagai aset yang terkompromi, dengan Lockhart menyarankan Brody harus dieliminasi. Episode berakhir dengan Carrie menghadapi tantangan besar untuk menjemput Brody, yang kini menjadi buronan di Iran, sementara CIA bergulat dengan dampaknya.

Musim 3, Episode 12: Bintang - Setelah membunuh Akbari, Brody melarikan diri dan bersatu kembali dengan Carrie, mengungkapkan bahwa dia hamil. Namun, rencana ekstraksi mereka digagalkan oleh Dar Adal, yang mengarah pada eksekusi publik Brody di Iran. Empat bulan kemudian, Carrie, yang kini menjadi kepala stasiun di Istanbul, diam-diam menambahkan bintang untuk Brody di dinding peringatan CIA.