Alors que la remise des diplômes approche, Scott McCall, un loup-garou et chef de sa meute, et ses amis font face à une menace surnaturelle : les Ghost Riders. Ces êtres spectraux effacent les gens de l'existence, volant leurs souvenirs et leurs vies. Le meilleur ami de Scott, Stiles Stilinski, est parmi les premiers à être ciblé et effacé de la mémoire de tous sauf de Lydia Martin, une banshee qui peut sentir le surnaturel. Le conflit principal tourne autour de Scott, Lydia et Malia Tate, une coyote-garou, qui essaient de se souvenir de Stiles et de trouver un moyen de le ramener avant que les Ghost Riders ne fassent d'autres victimes.

Les Ghost Riders sont dirigés par M. Douglas, qui cherche à consommer l'énergie surnaturelle. La meute découvre que les banshees sont immunisées contre le pouvoir des Ghost Riders, et Lydia devient cruciale dans leur combat. Ils apprennent que Stiles est piégé dans une dimension surnaturelle et doivent trouver un moyen d'ouvrir une brèche pour le secourir. Pendant leurs efforts, Peter Hale se sacrifie pour sauver Malia, et Theo Raeken fait un sacrifice pour protéger Liam Dunbar. Finalement, ils réussissent à ramener Stiles, mais la menace des Ghost Riders et de leur chef, Douglas, est résolue.

Cependant, un nouveau danger émerge avec l'arrivée de chasseurs dirigés par Mme Monroe, qui est secrètement conseillée par Gerard Argent. L'objectif de Monroe est d'éradiquer tous les êtres surnaturels. La meute fait face à des attaques croissantes, y compris l'empoisonnement et la mort de Brett Talbot. Dans une confrontation finale, Scott se rend aveugle pour vaincre l'Anuk-Ite, une créature de peur, avec l'aide de Stiles. La saison se termine avec Scott et ses alliés continuant leur combat contre Monroe, prêts à protéger la communauté surnaturelle.

La saison 6 de Teen Wolf couvre les épisodes 1-20. Voici tout ce qui s'est passé:

Saison 6, Épisode 1 : Mémoire perdue - Alors que la remise des diplômes approche, Scott et ses amis font face à une force surnaturelle. Stiles enquête sur une famille disparue et réalise qu'ils ont été enlevés par les Ghost Riders. Stiles est ciblé et effacé de la mémoire de tous, sauf de celle de Lydia. Il dit à Lydia de se souvenir de lui avant d'être emporté par la Chasse Sauvage.

Saison 6, Épisode 2 : Superposition - Scott, Lydia et Malia sentent une personne disparue, éprouvant des trous de mémoire. Les pouvoirs de Corey évoluent, révélant qu'il peut voir les Cavaliers sans être vu. Ils trouvent une carte d'étudiant, ce qui les aide à se souvenir de Jake Sullivan. Claudia Stilinski est révélée être vivante. Lydia écrit "mischief", un indice pour le prénom de Stiles. À la station du shérif, Stilinski embrasse sa femme, mais le mot "Stiles" se forme. Lydia demande, "Qu'est-ce que c'est que ce Stiles ?".

Saison 6, Épisode 3 : Le Crépuscule - Pendant que Scott, Lydia et Malia cherchent des informations sur Stiles auprès du père institutionnalisé du shérif Stilinski, Liam et la « B-team » tentent de protéger Gwen des Cavaliers Fantômes. Une fête chez Scott ne parvient pas à empêcher le Cavalier Fantôme d'entrer, mais Parrish le dissuade. Argent revient, enquêtant sur un loup-garou mangeur d'âmes. Le shérif se souvient d'un détail clé sur Stiles.

Saison 6, Épisode 4 : Reliques - Scott et Liam essaient de protéger l'équipe de crosse des Cavaliers Fantômes, ce qui entraîne la disparition de plusieurs joueurs. Lydia cherche des reliques de Stiles, trouvant les dossiers médicaux de Claudia qui présentent des incohérences. Argent est blessé, et l'épisode se termine avec la révélation de la Jeep de Stiles, offrant une lueur d'espoir.

Saison 6, Épisode 5 : Silence radio - Stiles, piégé dans une gare fantomatique, rencontre Peter Hale. De retour à Beacon Hills, Lydia, Scott et Malia trouvent la jeep de Stiles, ce qui déclenche des souvenirs fragmentés. Stiles utilise une radio pour les contacter, les exhortant à "trouver Canaan". Peter s'échappe de la gare par le portail, mais est gravement brûlé et leur remet les clés de Stiles.

Saison 6, Épisode 6 : Ghosted - Scott, Lydia et Malia se rendent à Canaan, une ville fantôme, où ils rencontrent une banshee nommée Lenore, hantée par son fils mort. Liam et Hayden ressuscitent Theo pour les aider contre les cavaliers fantômes. Melissa sauve Argent des toxines surnaturelles du cavalier fantôme. L'épisode se termine avec la prise de conscience que les banshees sont immunisées contre l'effacement des cavaliers fantômes.

Saison 6, Épisode 7 : Sans cœur - Scott et Liam, avec l'aide réticente de Theo, piègent un Cavalier Fantôme, mais M. Douglas le tue et consomme sa glande pinéale. Peter Hale revient, et Malia force Melissa à le guérir pour qu'il puisse aider à retrouver Stiles. Le shérif Stilinski découvre la chambre de Stiles murée, se souvenant enfin de son fils. Corey est capturé par M. Douglas à la fin de l'épisode.

Saison 6, Épisode 8 : Blitzkrieg - Scott, Lydia et Malia prévoient d'entrer dans la faille pour sauver Stiles. Liam, Hayden et Mason négocient avec Theo pour en apprendre davantage sur Garrett Douglas. Le shérif Stilinski se souvient de Stiles, ce qui fait disparaître Claudia. Peter se sacrifie pour que Malia puisse échapper aux cavaliers fantômes. Douglas utilise Parrish pour ouvrir la faille.

Saison 6, Épisode 9 : Memory Found - Scott, Malia et Lydia tentent de restaurer la mémoire de Stiles en utilisant des expériences de mort imminente pour ouvrir une brèche. Liam et Theo distraient les Cavaliers Fantômes, ce qui conduit au sacrifice de Theo pour protéger Liam. Lydia se souvient de son baiser avec Stiles, déclenchant une brèche et l'apparition d'une silhouette. L'épisode se termine avec le retour possible de Stiles.

Saison 6, Épisode 10 : Riders on the Storm - Beacon Hills en péril, la meute de Scott affronte Douglas et les Ghost Riders dans un ultime combat. Stiles revient, retrouvant Lydia. Liam, Mason et Hayden travaillent à libérer Corey, tandis que Malia se rapproche de Peter. Scott détourne le train des Ghost Riders, sauvant la ville. Douglas est vaincu, devenant l'un de la Chasse. L'épisode se termine avec le groupe terminant le lycée et planifiant l'avenir.

Saison 6, Épisode 11 : Le Spider dit à la Mouche - Alors que Scott se prépare à quitter Beacon Hills, un Hellhound nommé Halwyn s'échappe de Eichen House. Halwyn est ensuite tué par la nouvelle conseillère d'orientation, Mme Monroe. Lydia a une vision, réalisant qu'ils ne peuvent pas partir. Stiles, au FBI, apprend que Derek est recherché pour meurtre de masse.

Saison 6, Épisode 12 : Talent brut - Scott et Malia enquêtent sur une balle unique, craignant un nouveau chasseur. Lydia affronte ses peurs à Eichen House, sauvant Parrish d'un médecin qui tuait des détenus surnaturels. Theo, désormais sans-abri, est attaqué. Brett Talbot est empoisonné à l'aconit par Monroe. Gerard Argent réapparaît, félicitant Monroe pour son "talent brut".

Saison 6, Épisode 13 : Images fantômes - La meute de Scott cherche Brett, qui est la cible de Gerard et Monroe. Melissa et Argent enquêtent sur un corps étrange et terrifiant sans ADN. Brett est heurté par une voiture et meurt, exposant la forme de loup-garou de Liam au public. Le plan de Gerard pour instiller la peur réussit, alors que la transformation de Liam est vue par une foule.

Saison 6, Épisode 14 : Face-à-sans-visage - Liam fait face à l'animosité à l'école après que sa transformation ait été vue. Scott tente de négocier la paix avec Monroe, mais découvre sa haine qui découle d'une rencontre passée avec la Bête. Liam découvre que Monroe est la nouvelle chasseuse. Parrish confronte et semble détruire la créature sans visage. L'épisode se termine avec la révélation que Gerard conseille Monroe.

Saison 6, Épisode 15 : Test de pression - Theo et deux loups-garous sont capturés et torturés, mais Theo les aide à s'échapper, ce qui conduit à leur arrestation. Scott essaie de les protéger, mais le Shérif refuse, provoquant l'encerclement du poste par Monroe. Le père de Scott négocie un accord : les loups vont au FBI, et la meute de Scott s'en va. Cependant, les loups sont assassinés. La meute décide qu'ils resteront et se battront.

Saison 6, Épisode 16 : Déclencheurs - La meute de Scott attire les chasseurs loin de l'armurerie de Gerard, mais la trouve vide, découvrant les restes de Jiang et Tierney. Liam lutte contre sa colère, manquant de peu de blesser Nolan. Scott et Malia se retrouvent piégés, mais Lydia les sauve. La carte mondiale du Néméton de Gerard est révélée, et Melissa est abattue alors que les armes de Gerard sont distribuées. L'épisode se termine par une attaque choquante contre la maison des McCall.

Saison 6, Épisode 17 : Werewolves of London - À Londres, Jackson et Ethan sont attaqués par des chasseurs, ce qui les amène à réaliser l'implication de Gerard. De retour à Beacon Hills, Scott, dont la mère a été abattue mais a survécu, décide de riposter et de recruter une armée. Lydia découvre que l'Anuk-Ite a un second visage. Jackson et Ethan retournent à Beacon Hills mais sont immédiatement capturés par Monroe.

Saison 6, Épisode 18 : Genotype - Scott et Liam identifient Mme Finch comme la voix sur le message vocal, apprenant que sa fille Quinn est l'autre moitié de l'Anuk-Ite. Lydia et Malia essaient de communiquer avec Halwyn, découvrant qu'il est vivant mais qu'il a besoin qu'on lui retire une balle. Quinn et Aaron fusionnent pour devenir l'Anuk-Ite. L'Anuk-Ite fusionné rencontre ensuite Gerard.

Saison 6, Épisode 19 : Verre brisé - Argent cherche Derek au Brésil, le trouvant avant que Kate Argent ne vole de la louve mortelle cruciale. Scott et Malia s'entraînent avec Deucalion, mais Deucalion est tué par les forces de Monroe. Nolan mène Liam dans un piège à l'hôpital. L'épisode se termine avec Scott et sa compagnie face à un grand nombre de chasseurs armés.

Saison 6, Épisode 20 : Les Loups de Guerre - Scott et sa meute font face à l'attaque finale de Gerard, avec des alliés anciens et nouveaux. Gabe est tué pendant la bataille. Scott se rend aveugle pour vaincre l'Anuk-Ite, qui est ensuite piégé par Stiles. Kate attaque Gerard, le tuant vraisemblablement. L'épisode se termine avec Scott et Argent secourant un nouveau loup-garou, continuant la lutte contre Monroe.