Nachdem die Erde durch religiöse Differenzen zerrissen wurde und die Menschheit am Rande der Auslöschung steht, schickt ein atheistischer Androiden-Architekt zwei seiner Kreationen, Mutter und Vater, um eine friedliche, gottlose Kolonie auf dem Planeten Kepler-22b zu gründen. Raised by Wolves begleitet Mutter und Vater bei ihrem Versuch, menschliche Kinder in diesem mysteriösen, unberührten Land aufzuziehen – eine tückische und schwierige Aufgabe, die durch die Ankunft der Mithraiker, einer tiefgläubigen religiösen Ordnung überlebender Menschen, gefährdet wird. Während die Androiden Kontakt mit diesem eifrigen und gefährlichen Volk aufnehmen, kämpfen sie darum, den Glauben ihrer eigenwilligen Kinder zu kontrollieren.