Hikaye, insanların "bilinmeyen"e karşı savaşlarını sürdürdüğü bir dünyada geçiyor; insanlığın düşmanı. Onlarca yıl önce "bilinmeyen"in istilası sırasında soğuk uyku tesislerine tahliye edilen çocuklar uykularından uyanır ve bedenlerinin bazı doğaüstü güçler geliştirdiğini öğrenirler. Tokyo Körfezi kapısından ortaya çıkan "bilinmeyen"den ülkeyi korumak için, genç erkekler ve kızlar Tokyo, Kanagawa ve Chiba şehirlerinin savunmasında savaşırlar.