Naruto: Shippuden, orijinal animasyon dizisi Naruto'nun devamıdır. Hikaye, biraz daha olgunlaşmış olan Uzumaki Naruto'nun, arkadaşını yılan benzeri Shinobi Orochimaru'nun pençesinden kurtarma çabasını merkezine alıyor. İki buçuk yılın ardından Naruto nihayet Konoha köyüne geri döner ve hayallerini gerçekleştirmek için harekete geçer, ancak bu kolay olmayacaktır; çünkü Akatsuki gibi birkaç (daha tehlikeli) düşman edinmiştir.