À medida que a formatura se aproxima, Scott McCall, um lobisomem e líder de sua matilha, e seus amigos enfrentam uma ameaça sobrenatural: os Cavaleiros Fantasmas. Esses seres espectrais apagam pessoas da existência, roubando suas memórias e vidas. O melhor amigo de Scott, Stiles Stilinski, é um dos primeiros a ser alvo e apagado da memória de todos, exceto de Lydia Martin, uma banshee que pode sentir o sobrenatural. O conflito central gira em torno de Scott, Lydia e Malia Tate, uma coiote, tentando se lembrar de Stiles e encontrar uma maneira de trazê-lo de volta antes que os Cavaleiros Fantasmas reivindiquem mais vítimas.

Os Cavaleiros Fantasmas são liderados pelo Sr. Douglas, que busca consumir energia sobrenatural. A matilha descobre que as banshees são imunes ao poder dos Cavaleiros Fantasmas, e Lydia se torna crucial em sua luta. Eles descobrem que Stiles está preso em uma dimensão sobrenatural e devem encontrar uma maneira de abrir uma fenda para resgatá-lo. Durante seus esforços, Peter Hale se sacrifica para salvar Malia, e Theo Raeken faz um sacrifício para proteger Liam Dunbar. No final, eles conseguem trazer Stiles de volta, mas a ameaça dos Cavaleiros Fantasmas e seu líder, Douglas, é resolvida.

No entanto, um novo perigo surge com a chegada de caçadores liderados pela Sra. Monroe, que é secretamente aconselhada por Gerard Argent. O objetivo de Monroe é erradicar todos os seres sobrenaturais. A matilha enfrenta ataques crescentes, incluindo o envenenamento e a morte de Brett Talbot. Em um confronto final, Scott cega a si mesmo para derrotar o Anuk-Ite, uma criatura do medo, com a ajuda de Stiles. A temporada termina com Scott e seus aliados continuando sua luta contra Monroe, prontos para proteger a comunidade sobrenatural.

A temporada 6 de Teen Wolf cobre os episódios 1-20. Aqui está tudo o que aconteceu:

Temporada 6, Episódio 1: Memória Perdida - Com a formatura se aproximando, Scott e seus amigos enfrentam uma força sobrenatural. Stiles investiga uma família desaparecida e percebe que eles foram levados pelos Cavaleiros Fantasmas. Stiles é alvo e apagado da memória de todos, exceto de Lydia. Ele diz a Lydia para se lembrar dele antes de ser levado pela Caçada Selvagem.

Temporada 6, Episódio 2: Superposição - Scott, Lydia e Malia sentem uma pessoa desaparecida, experimentando lapsos de memória. Os poderes de Corey evoluem, revelando que ele pode ver os Cavaleiros Fantasmas enquanto invisível. Eles encontram uma identidade de estudante, ajudando-os a lembrar de Jake Sullivan. Claudia Stilinski é revelada como viva. Lydia escreve "travessura", uma pista para o primeiro nome de Stiles. Na delegacia, Stilinski abraça sua esposa, mas a palavra "Stiles" se forma. Lydia pergunta, "O que diabos é um Stiles?".

Temporada 6, Episódio 3: Sundowning - Enquanto Scott, Lydia e Malia buscam informações sobre Stiles com o pai institucionalizado do Xerife Stilinski, Liam e a "equipe B" tentam proteger Gwen dos Cavaleiros Fantasmas. Uma festa na casa de Scott não consegue impedir a entrada do Cavaleiro Fantasma, mas Parrish o afasta. Argent retorna, investigando um lobisomem devorador de almas. O Xerife se lembra de um detalhe crucial sobre Stiles.

Temporada 6, Episódio 4: Relíquias - Scott e Liam tentam proteger o time de lacrosse dos Cavaleiros Fantasmas, resultando em vários jogadores sendo apagados. Lydia busca relíquias de Stiles, encontrando os registros médicos de Claudia que mostram inconsistências. Argent é ferido, e o episódio termina com a revelação do Jeep de Stiles, oferecendo um vislumbre de esperança.

Temporada 6, Episódio 5: Rádio Silêncio - Stiles, preso em uma estação de trem fantasma, encontra Peter Hale. De volta a Beacon Hills, Lydia, Scott e Malia encontram o jipe de Stiles, o que desencadeia memórias fragmentadas. Stiles usa um rádio para contatá-los, implorando para que "encontrem Canaan". Peter escapa da estação de trem pelo portal, mas fica severamente queimado e entrega as chaves de Stiles.

Temporada 6, Episódio 6: Ghosted - Scott, Lydia e Malia viajam para Canaan, uma cidade fantasma, onde encontram uma banshee chamada Lenore, que é assombrada por seu filho morto. Liam e Hayden ressuscitam Theo para ajudá-los contra os Cavaleiros Fantasmas. Melissa salva Argent das toxinas sobrenaturais do Cavaleiro Fantasma. O episódio termina com a constatação de que as banshees são imunes ao apagamento dos Cavaleiros Fantasmas.

Temporada 6, Episódio 7: Sem Coração - Scott e Liam, com a ajuda relutante de Theo, prendem um Cavaleiro Fantasma, mas o Sr. Douglas o mata e consome sua glândula pineal. Peter Hale retorna, e Malia força Melissa a curá-lo para que ele possa ajudar a encontrar Stiles. O Xerife Stilinski descobre o quarto de Stiles emparedado, finalmente se lembrando de seu filho. Corey é capturado pelo Sr. Douglas no final do episódio.

Temporada 6, Episódio 8: Blitzkrieg - Scott, Lydia e Malia planejam entrar na fenda para resgatar Stiles. Liam, Hayden e Mason negociam com Theo para saber sobre Garrett Douglas. O Xerife Stilinski se lembra de Stiles, fazendo Claudia desaparecer. Peter se sacrifica para que Malia possa escapar dos Cavaleiros Fantasmas. Douglas usa Parrish para abrir a fenda.

Temporada 6, Episódio 9: Memory Found - Scott, Malia e Lydia tentam restaurar a memória de Stiles usando experiências de quase morte para abrir uma fenda. Liam e Theo distraem os Ghost Riders, levando ao sacrifício de Theo para proteger Liam. Lydia se lembra de seu beijo com Stiles, desencadeando uma fenda e o aparecimento de uma figura. O episódio termina com Stiles (possivelmente) retornando.

Temporada 6, Episódio 10: Cavaleiros na Tempestade - Com Beacon Hills em perigo, o bando de Scott enfrenta Douglas e os Cavaleiros Fantasmas em um confronto final. Stiles retorna, reunindo-se com Lydia. Liam, Mason e Hayden trabalham para libertar Corey, enquanto Malia se conecta com Peter. Scott desvia o trem dos Cavaleiros Fantasmas, salvando a cidade. Douglas é derrotado, tornando-se um dos Caçadores. O episódio termina com o grupo terminando o ensino médio e planejando o futuro.

Temporada 6, Episódio 11: Disse a Aranha à Mosca - Enquanto Scott se prepara para deixar Beacon Hills, um Cão do Inferno chamado Halwyn escapa da Eichen House. Halwyn é então morto pela nova orientadora, Sra. Monroe. Lydia tem uma visão, percebendo que eles não podem ir embora. Stiles, no FBI, descobre que Derek é procurado por assassinato em massa.

Temporada 6, Episódio 12: Talento Bruto - Scott e Malia investigam uma bala única, temendo um novo caçador. Lydia confronta seus medos na Eichen House, salvando Parrish de um médico que estava matando internos sobrenaturais. Theo, agora desabrigado, é atacado. Brett Talbot é envenenado com acônito por Monroe. Gerard Argent reaparece, parabenizando Monroe por seu "talento bruto".

Temporada 6, Episódio 13: After Images - O bando de Scott procura por Brett, que é alvo de Gerard e Monroe. Melissa e Argent investigam um corpo estranho e aterrorizante sem DNA. Brett é atropelado e morre, expondo a forma de lobisomem de Liam ao público. O plano de Gerard de incutir medo é bem-sucedido, pois a transformação de Liam é testemunhada por uma multidão.

Temporada 6, Episódio 14: Face-to-Faceless - Liam enfrenta animosidade na escola após sua transformação ser testemunhada. Scott tenta negociar a paz com Monroe, mas descobre seu ódio decorrente de um encontro passado com a Fera. Liam descobre que Monroe é a nova caçadora. Parrish confronta e aparentemente destrói a criatura sem rosto. O episódio termina com a revelação de que Gerard está aconselhando Monroe.

Temporada 6, Episódio 15: Teste de Pressão - Theo e dois lobisomens são capturados e torturados, mas Theo os ajuda a escapar, levando à sua prisão. Scott tenta protegê-los, mas o Xerife recusa, fazendo com que Monroe cerque a delegacia. O pai de Scott intermedia um acordo: os lobos vão para o FBI e o bando de Scott vai embora. No entanto, os lobos são assassinados. O bando decide que ficará e lutará.

Temporada 6, Episódio 16: Gatilhos - O bando de Scott atrai caçadores para longe do arsenal de Gerard, mas o encontram vazio, descobrindo os restos mortais de Jiang e Tierney. Liam luta com sua raiva, quase machucando Nolan. Scott e Malia ficam presos, mas Lydia os salva. O mapa global do Nemeton de Gerard é revelado, e Melissa é baleada enquanto as armas de Gerard são distribuídas. O episódio termina com um ataque chocante à casa dos McCall.

Temporada 6, Episódio 17: Lobisomens de Londres - Em Londres, Jackson e Ethan são atacados por caçadores, levando-os a perceber o envolvimento de Gerard. De volta a Beacon Hills, Scott, cuja mãe foi baleada mas sobreviveu, decide revidar e recrutar um exército. Lydia descobre que o Anuk-Ite tem um segundo rosto. Jackson e Ethan retornam a Beacon Hills mas são imediatamente capturados por Monroe.

Temporada 6, Episódio 18: Genótipo - Scott e Liam identificam a Sra. Finch como a voz na caixa postal, descobrindo que sua filha Quinn é a outra metade do Anuk-Ite. Lydia e Malia tentam se comunicar com Halwyn, descobrindo que ele está vivo, mas precisa remover uma bala. Quinn e Aaron se fundem para se tornar o Anuk-Ite. O Anuk-Ite fundido então se encontra com Gerard.

Temporada 6, Episódio 19: Vidro Quebrado - Argent procura Derek no Brasil, encontrando-o antes que Kate Argent roube acônito crucial. Scott e Malia treinam com Deucalion, mas Deucalion é morto pelas forças de Monroe. Nolan leva Liam a uma armadilha no hospital. O episódio termina com Scott e companhia enfrentando um grande número de caçadores armados.

Temporada 6, Episódio 20: Os Lobos da Guerra - Scott e seu bando enfrentam o ataque final de Gerard, com aliados antigos e novos. Gabe é morto durante a batalha. Scott cega a si mesmo para derrotar o Anuk-Ite, que é então aprisionado por Stiles. Kate ataca Gerard, presumivelmente matando-o. O episódio termina com Scott e Argent resgatando um novo lobisomem, continuando a luta contra Monroe.