20 エピソード
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アトランティス遠征隊は、ジョン・シェパード大佐とエリザベス・ウィアー博士の指揮の下、ペガサス銀河にある失われた古代都市アトランティスを探索し、高度な技術と捕食的なレイスを倒す方法を求めていました。熟練したパイロットであり兵士であるシェパードは、地球とチームを守ることに駆り立てられ、外交官であるウィアーは複雑な異種間関係を乗り越えていました。彼らの主な目標は、人間を餌とする強力な異星人種であるレイスから身を守り、潜在的に天の川銀河を守る方法を見つけることでした。
遠征隊が複数の脅威に直面するにつれて、シーズンの中心的な対立は激化しました。彼らは、アトランティスを脅威とみなし、地球へのゲートアドレスを持つ、古代人によって作られた高度な人間型レプリケーターであるアシュランを発見しました。チームはまた、より大きな攻撃を防ぐために人間型レイスのコロニーを破壊するという困難な決定など、自分たちの行動の倫理的な意味合いにも苦慮しました。シェパード大佐が捕らえられたレイスと同盟を結ぶという予期せぬ同盟を結んだことで、大きな転換点が訪れ、人間とレイスの関係の変化を示唆しました。シーズンは、古代人がアトランティスを奪還したことで最高潮に達しますが、遠征隊は彼らがすべてアシュランに殺されたことを発見します。その後、チームは都市をレプリケーターから奪還し、その破壊を防ぐために戦わなければなりませんでした。
シーズンは、アトランティスチームがアシュランから都市を無事に奪還し、再び確保したことで終わります。しかし、危険な人間とレイスのハイブリッドであるマイケルと、アシュランの存続の脅威が大きくのしかかり、将来の紛争の舞台を設定しました。シーズンでは、遠征隊の愛されたメンバーであるカーソン・ベケット博士の悲劇的な死も見られました。
Stargate Atlantisのシーズン3は、エピソード1から20までをカバーしています。すべてをまとめると：
シーズン3、エピソード1：ノー・マンズ・ランド - 2隻のレイスのハイブ船が地球に向かって競走する。シェパードは1隻に潜入し、マッケイとロナンはもう1隻から脱出する。
シーズン3、エピソード2：忌まわしき者 - アトランティスチームは、人型のレイスのコロニーが secluded planet に存在することに対する倫理的なジレンマに苦しむ。レイスの記憶を取り戻したマイケル・ケンモアは反乱を率い、ベケット博士を捕らえる。迫りくるレイスのハイヴに直面し、シェパードは取り返しのつかない決断を下し、惑星を破壊することを決意し、人型のレイスを抹殺する。チームはクロークされたパドルジャンパーで脱出するが、デダルスが見つけたのは残骸だけだった。
シーズン3、エピソード3：抗いがたい魅力 - アトランティス遠征隊は、フェロモンベースの薬によってその魅力で皆を虜にする、不快な男、ルシウス・ラヴィンに出会う。風邪のために免疫のあるシェパードだけが抵抗する。ルシウスはチームを操り、危険なレイスの惑星への任務にさえ送り込む。シェパードと治癒したベケットは解毒剤を開発し、ルシウスの力を剥奪する。ルシウスは故郷の惑星に送り返され、全てに対する彼の影響力は打ち砕かれる。
シーズン3、エピソード4：サテダ - ロノンは捕らえられ、荒廃した故郷サテダに連れ戻され、レイスに狩られることになる。アトランティスチームが救出を試みる中、ロノンは妻を失ったことを含むトラウマ的な過去と対峙し、狩る者を組織的に排除していく。最終的に、彼は惑星の破壊に責任を持つレイスとの復讐の対決を繰り広げ、彼を殺して狩りを終わらせる。
シーズン3、エピソード5：子孫 - アトランティス遠征隊は、古代人が住むと信じていた高度な都市を発見する。しかし、彼らは古代人がレイスに対抗するために作り出した人間型のレプリケーター（アスーラン）であることが判明し、今やアトランティスを破壊しようとしていた。捕らえられ、精神を調べられた後、チームはアスーランの一人、ニアムを再プログラムして協力を得る。彼らは、アスーランの都市船がアトランティスに到達するのを阻止するため、それを破壊せざるを得なくなるが、ニアムは遠隔操作でリセットされ、宇宙に放出される。アスーランは、アトランティスと地球の両方のゲートアドレスを手に入れた。
シーズン3、エピソード6：ザ・リアル・ワールド - エリザベス・ウィアー博士は精神病院で目を覚まし、自動車事故の後、アトランティスでの経験は妄想だったと確信している。その事故は婚約者を死なせた。実際には、彼女はレプリケーターのナノマシンに感染し、アトランティスで昏睡状態に陥っていた。ウィアーは自分自身を救うために、レプリケーターの偽りの現実と精神的に戦わなければならない。最終的に彼女は精神操作から解放され、アトランティスで意識を取り戻す。
シーズン3、エピソード7：共通の基盤 - シェパード大佐は宿敵コリャに捕らえられる。コリャは、アトランティスにラドン・ラディムを引き渡すよう強要するため、シェパードをレイスに吸わせるという拷問を行う。シェパードは捕らえられたレイスと意外な同盟を結び、共に脱出する。コリャは脱出中にレイスに殺される、そしてレイスは一時的にシェパードの生命力を回復させる。この予期せぬ協力関係は、人間とレイスの関係における重要な転換点となる。
シーズン3、エピソード8：マッケイとミラー夫人 - ロドニー・マッケイは、疎遠になっている優秀な妹、ジーニーをアトランティスに招き、無限エネルギー実験を行う。これが不注意にも並行宇宙への架け橋を開いてしまい、別の、英雄的なロドニーが登場する。スターゲイト計画がジーニーに明かされる、そして別のロドニーは最終的に、両方の現実が崩壊するのを防ぐために自らを犠牲にする。
シーズン3、エピソード9：幻影 - シェパード率いるチームは、行方不明の部隊を調査し、レイスの精神操作装置の犠牲となったジェニーとアトランティスの人員の死体を発見する。惑星に閉じ込められたチームは、鮮明で危険な幻覚を体験し、互いに攻撃し合うようになる。激しい争いと負傷の後、マッケイは装置のシャットダウンに成功し、妄想を終わらせ、チームの回復を可能にする。
シーズン3、エピソード10：帰還、パート1 - マッケイ/カーター銀河間ゲートブリッジのテストは成功するが、古代の戦艦トリアが到着し、古代人がアトランティスを奪還し、遠征隊を地球へ追放する。新しい生活に苦労するチームは、アシュランが都市に向かっていることを知る。SGCが銀河系へのレプリケーター侵攻を防ぐためにアトランティスを破壊する計画を立てる中、元遠征隊は戻らなければならないと悟る。
シーズン3、エピソード11：帰還、パート2 - シェパード率いるチームは、オニール将軍とリチャード・ウールジーを捕らえたアシュランからアトランティス奪還のため、命令に背く。彼らは、アトランティスに戻った全ての古代人がレプリケーターに殺されたことを発見する。マッケイは、友好的なレプリケーターであるニアムを破壊することを余儀なくされる。チームはアトランティスを奪還し、その核破壊を防ぎ、再び都市を確保することに成功する。
シーズン3、エピソード12：エコー - ランテアのクジラがアトランティスに集まる中、街の住人は苦悩する古代人の幻を体験する。マッケイ博士は、これらの幻が近くの太陽からの差し迫ったコロナ質量放出に関するクジラからのテレパシーによる警告であり、アトランティスを破壊する恐れがあることを発見する。チームは惑星の磁場を安定させることに成功し、大災害を回避して、街とクジラの両方を救う。
シーズン3、エピソード13：無責任 - シェパード大佐のチームは再び、古代人の個人シールドを使って無敵を装うルシウス・ラヴィンをヒーローとして見つける。アトランティスチームを捕獲するためにシェパードの宿敵であるアカストゥス・コリヤが現れると、彼の欺瞞は暴かれる。シェパードとルシウスは不本意ながら協力し、村人たちに反撃を促す。最終対決で、シェパードはコリヤを決闘で殺す。その後、ルシウスの個人シールドはパワーを失い、彼の無敵は終わる。
シーズン3、エピソード14：ロドニーの道 - ロドニー・マッケイ博士は古代の装置に感電し、急速に進化が加速して超能力と計り知れない知能を得る。しかし、このプロセスは彼をゆっくりと死に至らしめており、彼はアセンションを試みることを余儀なくされる。死の淵で、マッケイはベケット博士に精神的に指示を送り、その効果を元に戻し、彼を元の状態に戻す。
シーズン3、エピソード15：ゲーム - マッケイ博士とシェパード中佐は、秘密裏にプレイしていた古代の戦略ゲームが、現実世界の2つの文明を制御していることを発見する。彼らの競争的なゲームプレイは、意図せずして、両社会を本格的な戦争へとエスカレートさせてしまった。真実を明かしたにもかかわらず、指導者たちの敵意は消えず、両陣営が先進的な兵器を発射したことで、相互確証破壊へとつながる。
シーズン3、エピソード16：方舟 - アトランティスチームは、レイスから逃れるために休眠状態にある文明を収容した、くり抜かれた月の内部にある宇宙ステーションを発見する。マッケイ博士がヘンリックという名の科学者を覚醒させると、彼らはステーションの目的を知る。しかし、ヘンリックは自殺し、ステーションの破壊を試みる。これによりチームは孤立し、月は軌道を外れる。チームは急速に劣化するステーションに取り残され、救助を待つことになる。
シーズン3、エピソード17：サンデー - アトランティスの職員たちは、滅多にない休日を楽しむが、謎の爆発が都市を壊滅させる。マッケイ博士は、古代の装置が人々を生きる爆弾に変えることを発見する。ベケット博士は、犠牲者から爆発性の腫瘍を取り除く手術を勇敢に行う。悲劇的なことに、摘出した腫瘍を移送中に、それは爆発し、カーソン・ベケット博士は死亡する。エピソードは、愛された医師の厳粛な葬儀で締めくくられる。
シーズン3、エピソード18：潜水 - アトランティスチームは、新しい動力源を探して古代の水中掘削ステーションを調査するが、テイラはレイスの気配を感じる。墜落した巡洋艦で数千年を生き延びたレイスのクイーンがテイラに憑依し、ステーションを破壊してチームを閉じ込める。テイラは捕らえられたクイーンを精神的に尋問し、クイーンが巡洋艦を自爆させるように設定し、アトランティスを脅かしていたことを知る。テイラはその後、偽の記憶を使ってレイスのクイーンを欺き、自爆シーケンスを無効化させる。これにより、レイスのクイーンは死亡する。
シーズン3、エピソード19：復讐 - アトランティスチームは行方不明のタラニア人の集落を調査し、人間とレイスのハイブリッドであるマイケルによって、住民が虐殺され実験に使われたことを発見する。マイケルは強力な昆虫のような新種を作り出していた。テイラはマイケルに捕らえられるが、シェパードのチームは最終的に彼の研究所とクリーチャーを破壊する。マイケルは逃亡し、他の隠された施設と共に重大な脅威として残る。
シーズン3、エピソード20：ファースト・ストライク - 地球の「アポロ」は先制攻撃を行い、アスラン艦隊を破壊する。報復として、衛星兵器がアトランティスを標的とする。
⚠️ 1 新しいエピソードあり
