Doujin Work segue la vita di una giovane ragazza di nome Najimi Osana e il suo ingresso nel mondo del doujin. Inizialmente è stata tentata di diventare un'artista doujin dopo aver visto quanto una sua amica potesse guadagnare a una convention. A Najimi piace disegnare, anche se presto scopre, contrariamente a quanto si aspettava, che questo nuovo mondo è tutt'altro che facile. Partecipando a più convention e incontrando più persone, Najimi riesce infine a trovare un gruppo di amici molto interessanti. Questi amici hanno già una certa esperienza nel settore e la aiutano lungo il cammino, in modo che un giorno possa farsi un nome creando doujinshi.