Takdirnya akhirnya tiba saat Shirou Kamui muda kembali ke Tokyo setelah 6 tahun. Seorang psikis yang kuat, Kamui bersumpah untuk melindungi kebahagiaan teman masa kecilnya, Fuuma dan Kotori, bahkan jika itu berarti menghindar dari mereka. Namun takdir itu kejam, terlepas dari apakah Kamui ingin terlibat atau tidak; ia memegang masa depan dunia di tangannya, diberi pilihan untuk menjadi Naga Langit atau Naga Bumi. Tujuh Segel berkumpul, begitu pula Tujuh Malaikat; semua individu yang takdirnya telah terukir sebagai orang yang akan bertarung demi nasib dunia. Masa depan seperti apa yang akan Kamui pilih untuk menjadi kenyataan?