Tree Fu Tom bercerita tentang petualangan luar biasa seorang anak laki-laki bernama Tom yang, dengan kekuatan "sihir gerakan" yang disebut "Tree Fu", dapat berubah menjadi pahlawan super ajaib yang mungil namun perkasa dan melakukan perjalanan ke kerajaan ajaib yang menakjubkan bernama Treetopolis yang ada di dalam pohon di taman belakang rumahnya.