Jauh di alam semesta, pertempuran sengit berkecamuk di planet Cybertron yang jauh. Di sana, Autobot yang heroik dan Decepticon yang jahat saling bertarung memperebutkan sekelompok robot yang disebut Mini-Con, yang kekuatannya dapat meningkatkan kemampuan Transformer dalam pertempuran. Menyadari bahwa pertempuran untuk Mini-Con terbukti terlalu mahal, para Transformer mengirim Mini-Con menjauh dari Cybertron dalam sebuah kapal besar, tetapi ketika kapal itu jatuh di sebuah planet terpencil, hal itu memicu serangkaian peristiwa yang akhirnya mengarah pada persaingan sengit antara Autobot dan Decepticon yang diperebutkan di Bumi. Begitu berada di Bumi, pertempuran untuk Mini-Con dimulai kembali, dengan Autobot mendapatkan sekutu manusia baru dalam upaya mereka untuk menemukan semua "alat pintar" yang berharga sebelum Decepticon dapat menggunakan kekuatan mereka untuk mencapai kekuasaan atas galaksi... tetapi saat pertempuran berkecamuk, kejahatan yang lebih besar mengintai dalam bayang-bayang, sang pembunuh planet raksasa Unicron...