Saat penyelaman kapal selam rutin, ahli oseanografi Laura Daughtery menemukan bentuk kehidupan yang tidak diketahui dan mengungkap operasi penutupan pemerintah yang dipimpin oleh ilmuwan Dr. Aleksander Cirko. Sementara itu, nelayan Louisiana Richard Beck kehilangan saudaranya dalam kecelakaan menyelam yang mencurigakan, dan seorang anak laki-laki bernama Miles menyelundupkan telur akuatik yang tidak biasa ke rumahnya. Dari Laut Antartika Selatan dan Teluk Meksiko hingga San Diego dan Monterey, ada sesuatu yang mengintai di bawah Permukaan.