Terinspirasi oleh film blockbuster dan dua serial televisi populer yang merupakan kelanjutannya: Stargate: SG-1 dan Stargate: Atlantis, Stargate: Infinity semakin menjelajahi alam semesta melalui mata segelintir orang yang cukup berani untuk berpetualang melalui Stargate yang misterius. Serial animasi ini mengisahkan satu generasi setelah SGC pertama kali melangkah melalui perangkat asing yang dikenal sebagai Stargate. Perang melawan Goa'uld parasit yang jahat telah dimenangkan. Stargate Command yang dulunya sangat rahasia dan pekerjaannya telah dideklasifikasi, dan makhluk dari dunia lain hidup di antara kita. Namun kini ada ancaman baru dan Mayor Gus Bonner harus memimpin sekelompok kadet SGC muda melalui Stargate untuk melindungi kehidupan seorang Ancient dari musuh baru yang memusuhi.