Melindungi dunia yang tidak tahu keberadaan mereka. Mutant X adalah tim mutan manusia yang memiliki kekuatan luar biasa sebagai hasil rekayasa genetika. Seperti ratusan subjek lain yang tidak menaruh curiga, orang-orang ini diubah dalam eksperimen rahasia yang dilakukan dalam proyek pemerintah terselubung. Menyadari bahwa keadaan telah lepas kendali, organisasi yang menciptakan mereka kini memburu mereka dalam "penarikan produk" yang mendesak. Misi Mutant X adalah mencari sesama mutan baru mereka, membantu mereka menerima kemampuan luar biasa mereka, dan melindungi mereka dari para pencipta mereka.