Pure raconte l'histoire de Noah Funk, un pasteur mennonite nouvellement élu, déterminé à débarrasser sa communauté des trafiquants de drogue en dénonçant un autre mennonite à la police. Mais au lieu de résoudre le problème, les actions de Noah déclenchent un ultimatum de la part du chef de la mafia mennonite, Eli Voss : pour protéger sa famille, il doit s'impliquer dans l'opération illégale. Noah décide que s'il doit travailler pour la mafia, il rassemblera secrètement suffisamment de preuves pour démanteler l'organisation. Cachés des regards, les mennonites de l'Ancien Ordre vivent dans leur propre monde, dédiés à un mode de vie simple, identique à celui de leurs ancêtres. Cependant, un faible pourcentage de mennonites hors-la-loi contrôle l'une des opérations de trafic de drogue les plus efficaces en Amérique du Nord. Alimentée par une alliance impie avec le cartel de Juarez, leur filière s'étend du Mexique, traverse les États-Unis et arrive au Canada. Noah voit ses croyances et ses principes remis en question à chaque étape. Luttant pour sauver son âme et accomplir sa mission, Noah reçoit l'aide d'une source improbable : son ennemi juré du lycée, le policier local Bronco Novak. Avec sa carrière dans les forces de l'ordre au point mort, Bronco voit l'affaire de la mafia mennonite comme son ticket pour la rédemption.