Inspirée de faits réels, Population 11 suit un homme qui disparaît d'une petite ville isolée de seulement 12 habitants, et son fils éloigné, qui voyage depuis les États-Unis pour le retrouver. Lorsque Andy Pruden, un employé de banque de banlieue de l'Ohio, arrive dans cette petite ville reculée pour rendre visite à son père qu'il a perdu de vue depuis longtemps, il découvre avec effroi que Hugo a disparu. Dans sa quête pour le retrouver, une autre étrangère, Cassie, vient en aide à Andy et ils se retrouvent en danger croissant alors qu'ils explorent les secrets de cette petite ville isolée, où tout le monde est suspect.