Doujin Work suit la vie d'une jeune fille nommée Najimi Osana et son immersion dans le monde du doujin. Elle est d'abord tentée de devenir artiste doujin après avoir vu combien l'une de ses amies peut gagner lors d'une convention. Najimi adore dessiner, mais apprend vite que, contrairement à ses attentes, ce nouveau monde est tout sauf facile. Au fil des conventions et des rencontres, Najimi finit par trouver un groupe d'amis très intéressants. Ces amis ont déjà de l'expérience dans le domaine et l'aident en cours de route pour qu'elle puisse un jour se faire un nom en créant des doujinshi.