„Hundred“ – das ist die einzige Waffe, die der mysteriösen Lebensform „Savage“, die die Erde bedroht, etwas entgegensetzen kann. Der Protagonist Kirasagi Hayato strebt danach, mit diesem „Hundred“ ein Meister der Kampfkünste zu werden. Er schafft es, an der Schlachtschiff-Universität Little Garden aufgenommen zu werden. Doch – „Ich wollte dich sehen, Hayato!!!“ „W-Woher kennst du meinen Namen?“ Um seinen Mitbewohner Emil Crossford, der ihn seltsamerweise gut zu kennen scheint (?), herum fühlt sich Hayato unwohl. Mehr noch, kurz nach der Einführungszeremonie wird er von der stärksten Kampfkünstlerin der Universität, der „Queen“ Claire Harvey, zu einem Duell herausgefordert…!? Hier beginnt der ultimative Kampf der Akademie!