Naruto verfolgt eng das Leben eines Jungen, der von den Dorfbewohnern des versteckten Blendorfes Konoha gefürchtet und verachtet wird. Das Misstrauen gegenüber dem Jungen hat wenig mit ihm selbst zu tun, sondern mit dem, was in ihm steckt, was Angst verursacht. Lange bevor Naruto geboren wurde, führte ein Kyuubi (Dämonenfuchs) mit großer Wut und Macht Krieg und forderte viele Leben. Der Kampf dauerte lange, bis ein Mann, bekannt als der Vierte Hokage, Yondaime, der stärkste Ninja in Konoha, den Kyuubi heftig bekämpfte. Der Kampf wurde bald von Yondaime gewonnen, als er das böse Wesen in einem menschlichen Körper versiegelte. So wurde der Junge, Naruto, geboren. Während Naruto heranwächst, beschließt er, der stärkste Ninja in Konoha zu werden, um allen zu zeigen, dass er nicht so ist, wie sie ihn wahrnehmen, sondern ein Mensch, der Liebe und Bewunderung verdient. Doch der Weg zum Hokage, dem Titel für den stärksten Ninja in Konoha, ist lang und beschwerlich. Es ist ein Pfad voller Verrat, Schmerz und Verlust; aber mit harter Arbeit könnte Naruto Hokage werden.