Evrenin çok uzaklarında, uzak bir gezegen olan Cybertron'da şiddetli bir savaş sürüyor. Orada, kahraman Autobotlar ve kötü Decepticonlar, savaşta bir Transformer'ın yeteneklerini geliştirebilen Mini-Con adlı bir grup robot için çarpışıyor. Mini-Con'lar için verilen savaşın çok pahalıya mal olduğunu fark eden Transformerlar, Mini-Con'ları büyük bir gemiyle Cybertron'dan uzaklaştırdılar, ancak gemi uzak bir gezegene zorunlu iniş yaptığında, Autobotlar ve Decepticonlar arasındaki hararetli rekabetin Dünya'da yaşanmasına yol açan bir dizi olayı tetikler. Dünya'ya ayak bastıklarında, Mini-Con'lar için savaş yeniden başlar, Autobotlar, Decepticonlar galaksi üzerinde hakimiyet kurmak için güçlerini kullanmadan önce tüm değerli "Akıllı Araçları" bulma arayışlarında yeni insan müttefikler kazanır... ancak savaş sürerken, gölgelerde daha büyük bir kötülük gizlenir, dev gezegen yok edici Unicron...