"Görev T", dünyanın yok olmasını engellemek için yürütülen bir casusluk ve gizli istihbarat gölge savaşıdır. Hikaye, çocukluğundan beri ninja olarak eğitim görmüş ve yetenekli bir casus olarak yetişmiş Botan Negoro'yu takip ediyor. Dünyanın kaderinin tehlikede olduğu yeni bir görevde, gösterişli bir casus olan Kuruma ile takım olur: dahi Sırp-Amerikalı mucit Nikola Tesla'nın "mirası" olan "Tesla Kristali"ni ele geçirmek. Ancak diğer ülkeler ve ajanları Tesla Kristali'ni güvence altına almak için çoktan harekete geçmişlerdir ve Botan ile Kuruma, onları alt etmek için tüm zekalarını kullanmak zorunda kalacaktır.