Uluslararası bir uçuş Boston'un Logan Havalimanı'na indiğinde, yolcular ve mürettebat korkunç ölümlerle hayatlarını kaybeder. FBI Özel Ajanı Olivia Dunham, olayı araştırmak üzere çağrılır. Ortaklığı neredeyse öldürüldüğünde, çaresiz Olivia yardım arayışına girer ve onu, neslimizin Einstein'ı olan Dr. Walter Bishop'a yönlendirir. Tek bir sorun vardır: Son yirmi yıldır akıl hastanesinde yatmaktadır ve onu sorgulamanın tek yolu, ayrılmış oğlu Peter'ı yardım için devreye sokmaktır. Olivia'nın araştırması onu manipülatif bir kurumsal yöneticinin izine götürdüğünde, o ve ekibi, Uçuş 627'de meydana gelenlerin daha büyük ve daha şok edici bir gerçeğin yalnızca küçük bir parçası olduğunu keşfedecek ve mümkün ile imkansız arasındaki bulanık çizgiyi araştıracaklardır.