Priča se odigrava u svetu gde ljudi nastavljaju rat protiv "nepoznatog" – neprijatelja čovečanstva. Deca koja su evakuisana u objekat za hladno spavanje tokom invazije "nepoznatog" pre nekoliko decenija, bude se iz svog sna i saznaju da su njihova tela razvila neke natprirodne sile. Da bi zaštitili zemlju od "nepoznatog" koji izlazi iz kapije Tokijskog zaliva, dečaci i devojčice vode bitke u odbrani gradova Tokija, Kanagawe i Čibe.