Radnja se odigrava u paralelnom svetu Fate/stay night, gde je Veliki Sveti Kalež misteriozno nestao iz Fjukija nakon Trećeg Svetog Kaleža Rata. Nakon mnogo godina tišine, otprilike u isto vreme kada bi se odigrao Peti Sveti Kalež Rat, Jgamilenija, porodica mađioničara, otvoreno proglašava svoje otcepljenje od Udruženja Mađioničara i da poseduju Kalež. Udruženje šalje pedeset mađioničara da ga povrate, a svi osim jednog bivaju trenutno masakrirani od strane misterioznog Sluge. Jedini preživeli uspeva da aktivira rezervni sistem Velikog Kaleža, omogućavajući prizivanje četrnaest Sluga ukupno. U gradu Trifas, dve frakcije će se boriti za kontrolu nad svetim relikvijem, svaka posedujući svoj tim od sedam Sluga: Crna Frakcija, čiji su članovi deo Jgamilenije, štiteći Kalež, i Crvena Frakcija, čiji su članovi poslati od strane Udruženja Mađioničara, pokušavajući da povrate Kalež. Za događaj ovakvih razmera, sam Kalež priziva svog Slugu, svetog Vladara, da nadgleda sukob. Ovo označava početak Velikog Svetog Kaleža Rata.