Godine 2016. havarija nuklearne elektrane kontaminira Tokio, primoravajući vladu da naredi evakuaciju svojih građana. 20 godina kasnije, Tokio je postao grad duhova zbog visokog nivoa zračenja, u koji je vlada zabranila ulaz svima. Kada stigne poziv u pomoć iz tog područja, Japanske kopnene snage samoodbrane šalju tri devojke iz specijalne jedinice Kopelion da pretraže uništenu prestonicu u potrazi za preživelima.
