Os habitantes do planeta Thundera evacuam pouco antes de sua destruição. Eles foram perseguidos por uma gangue de mutantes. Todas as suas naves de fuga, exceto uma, foram destruídas. Restou apenas um pequeno grupo de Thunderanos (ThunderCats). Com apenas metade da potência do motor, o grupo, liderado por Jaga, teve que traçar um curso para o planeta mais próximo. Jaga comandou sua nave enquanto os outros 7 estavam em seus tubos de estase. Jaga morreu em sua jornada para a Terceira Terra e sua nave caiu lá. Logo fizeram amizade com vários grupos na área e projetaram uma fortaleza. Mumm-Ra, a encarnação secular do mal, juntamente com os mutantes que destruíram o resto dos Thunderanos, representam uma ameaça constante. Mas Lion-O, o novo líder dos ThunderCats, com sua arma a "Espada de Omens", ajudará os ThunderCats a ter uma chance de lutar.