Naruto: Shippuden é a continuação da série animada original Naruto. A história gira em torno de um Uzumaki Naruto mais velho e um pouco mais maduro em sua busca para salvar seu amigo Uchiha Sasuke das garras do shinobi em forma de cobra, Orochimaru. Após 2 anos e meio, Naruto finalmente retorna à sua vila de Konoha e começa a colocar suas ambições em prática, embora não seja fácil, já que ele acumulou alguns inimigos (mais perigosos), como a organização shinobi; Akatsuki.