A história se passa em um mundo onde as pessoas continuam sua guerra contra o "desconhecido" — o inimigo da humanidade. Crianças que foram evacuadas para uma instalação de sono criogênico durante a invasão do "desconhecido" décadas atrás acordam de seu sono e descobrem que seus corpos desenvolveram algumas forças sobrenaturais. Para proteger o país do "desconhecido" que emerge do portão da baía de Tóquio, os meninos e meninas travam batalhas na defesa das cidades de Tóquio, Kanagawa e Chiba.