Ambientado em um Brasil de universo alternativo, Michiko to Hatchin conta a história de Hana Morenos. Hana é rotineiramente abusada por todos os membros de sua família adotiva, que só cuidam dela porque o governo os paga para isso... até que um dia, uma foragida da prisão chamada Michiko Malandro invade a janela da cozinha deles em uma motocicleta, alegando ser a verdadeira mãe de Hana. Confusa, mas disposta a fazer qualquer coisa para escapar, Hana concorda em ir com ela...