Yoshimori Sumimura, um garoto de 14 anos do ensino fundamental, é um Kekkaishi, um exterminador de monstros. Ele compete com Tokine Yumikura para ser o herdeiro do clã Sumimura. Tokine é mais velha que ele, e é sua amiga de infância, assim como sua rival Kekkaishi. Para salvar as pessoas do perigo e se tornar mais forte, Yoshimori luta contra monstros.