Inukami! gira em torno de Keita Kawahira, um descendente de um clã de domadores de Inukami e considerado um fracasso pelo clã devido à sua atitude em relação ao seu dever. Inukami, que significa literalmente "deus cachorro", são criaturas benevolentes que possuem poderes espirituais. Eles são um tipo de demônio com aparência de cachorro que pode se transformar em forma humana. Juntamente com um parceiro do histórico clã de domadores de Inukami, eles agem para obliterar o mal e proliferar a retidão. Keita inicialmente não consegue encontrar um Inukami com quem se conectar, mas eventualmente uma bela Inukami chamada Yoko decide se tornar sua Inukami, fazendo com que Keita fique radiante de alegria. No entanto, sua alegria é de curta duração quando ele descobre que ela é uma Inukami muito problemática e incontrolável. A partir de então, a vida de Keita se torna repleta de embaraços sem fim.