Doujin Work acompanha a vida de uma jovem chamada Najimi Osana e sua entrada no mundo doujin. Ela foi tentada a se tornar uma artista doujin após ver quanto uma de suas amigas ganhava em uma convenção. Najimi adora desenhar, embora logo aprenda, ao contrário do que esperava, que este novo mundo é tudo, menos fácil. À medida que frequenta mais convenções e conhece mais pessoas, Najimi eventualmente consegue encontrar um grupo de amigos muito interessantes. Esses amigos já têm alguma experiência na área e a ajudam ao longo do caminho para que ela um dia possa se destacar criando doujinshi.