Absentia acompanha uma agente do FBI que, enquanto caçava um dos serial killers mais notórios de Boston, desaparece sem deixar rastro e é declarada morta. Seis anos depois, ela é encontrada em uma cabana na floresta, mal viva e sem memória dos anos em que esteve desaparecida. Ao retornar para casa e descobrir que seu marido se casou novamente e seu filho está sendo criado por outra mulher, ela logo se vê implicada em uma nova série de assassinatos.