Młody chłopak imieniem Yugi Moto rozwiązuje starożytną egipską łamigłówkę i przywołuje mroczne i potężne alter ego. Ilekroć on i jego przyjaciele są zagrożeni przez zło, to alter ego uwalnia się z więzów Milenijnej Łamigłówki i rzuca wyzwanie złoczyńcom w Grach Cienia: sytuacjach życia lub śmierci, które testują prawdziwą naturę ludzkich istot. Ci, którzy przegrają lub oszukają, ponoszą poważne kary, które skutkują utratą poczytalności lub nawet życia. Wraz ze swoimi przyjaciółmi Joeyem, Tristanem, Teą i Miho; Yugi i jego mroczny odpowiednik stają do walki z wrogami takimi jak Seto Kaiba: bezwzględny mistrz gry karcianej Potwory z Pojedynku; oraz Ryo Bakura, który posiada Milenijny Pierścień zawierający ducha bardziej brutalnego niż Yami Yugi. Czy Yugi i jego przyjaciele odniosą sukces, czy też stracą swoje dusze?