"Headmasters" zaczyna się od Galvatrona prowadzącego nową grupę Destronów do wojny przeciwko Seibertronowi, Destrońskim Headmasterom. Cybertrony zostają uratowane przez przybycie Cybertrońskich Headmasterów, dowodzonych przez Fortressa (Cerebrosa, głowę Fortressa Maximusa). Okazuje się, że Fortress opuścił Seibertron miliony lat temu w poszukiwaniu energii i w końcu udało mu się wrócić do domu. Wyjaśnia, że Headmasterzy pochodzą z planety zwanej Master; żyjący tam roboci wielkości człowieka zbudowali sobie ciała wielkości Transformerów.