Daleko we wszechświecie, na odległej planecie Cybertron toczy się zacięta bitwa. Tam bohaterscy Autoboty i złowieszczy Deceptikoni ścierają się o grupę robotów zwanych Mini-Konami, których moc może wzmocnić zdolności Transformera w walce. Zdając sobie sprawę, że bitwa o Mini-Konów okazała się zbyt kosztowna, Transformery wysłały Mini-Konów z Cybertronu na pokładzie dużego statku. Jednak gdy statek rozbija się na odległej planecie, rozpoczyna się łańcuch wydarzeń, który ostatecznie prowadzi do zaciętej rywalizacji między Autobotami i Deceptikonami, która toczy się na Ziemi. Po przybyciu na Ziemię, bitwa o Mini-Konów rozpoczyna się na nowo, a Autoboty zyskują nowych ludzkich sojuszników w swojej misji odnalezienia wszystkich cennych "inteligentnych narzędzi", zanim Deceptikoni wykorzystają ich moc do zdobycia dominacji nad galaktyką... ale gdy bitwa szaleje, w cieniach czai się większe zło, gigantyczny zabójca planet, Unicron...