Star Trek: Akademia Gwiezdnej Floty rozgrywa się w XXXII wieku, w odległej przyszłości franczyzy Star Trek, gdzie Gwiezdna Flota i Zjednoczona Federacja Planet dochodzą do siebie po kataklizmicznym wydarzeniu, przedstawionym w Star Trek: Discovery. Serial przedstawia młodą grupę kadetów, którzy łączą siły, by realizować wspólne marzenie o nadziei i optymizmie. Pod czujnym i wymagającym okiem swoich instruktorów odkrywają, co potrzeba, aby zostać oficerami Gwiezdnej Floty, nawiązując kwitnące przyjaźnie, przeżywając wybuchowe rywalizacje, pierwsze miłości i stawiając czoła nowemu wrogowi, który zagraża zarówno Akademii, jak i samej Federacji.