"Czystość" opowiada historię Noego Funka, nowo wybranego pastora mennonickiego, który postanawia oczyścić swoją społeczność z handlarzy narkotyków, wydając jednego ze swoich współwyznawców policji. Jednak zamiast rozwiązać problem, działania Noego wywołują ultimatum ze strony przywódcy mafii mennonickiej, Eli Voss'a: aby chronić swoją rodzinę, musi zaangażować się w nielegalną działalność. Noe postanawia, że skoro musi pracować dla mafii, będzie potajemnie zbierał dowody wystarczające do rozbicia organizacji.
Ukryci przed wzrokiem, mennonici Starego Porządku żyją w swoim własnym świecie, oddani prostemu stylowi życia swoich przodków. Jednak niewielki procent mennonitów-rozbijaczy kontroluje jedną z najbardziej efektywnych operacji handlu narkotykami w Ameryce Północnej. Zaopatrywani przez nieświęty sojusz z kartelem z Juarez, ich szlak rozciąga się od Meksyku, przez USA, aż do Kanady.
Noe na każdym kroku zmaga się ze swoimi przekonaniami i zasadami. Walcząc o zbawienie swojej duszy i ukończenie misji, Noe otrzymuje pomoc z nieoczekiwanego źródła: swojego szkolnego wroga, lokalnego policjanta Bronco Novaka. Z karierą policyjną wiszącą na włosku, Bronco widzi sprawę mafii mennonickiej jako swoją szansę na odkupienie.