Onigiri rzuca graczy w mistyczną Japonię, krainę pełną mitycznych stworzeń z japońskich legend. Zaczynając jako samotny Oni, gracze walczą ze złowrogim wpływem Kamikui, gdy ich miasma rozprzestrzenia się po krainie. 8 NPC-ów, każdy z własną, odrębną osobowością i umiejętnościami, sprzymierza się z graczem, aby pomóc w budowaniu legendy i uciszeniu zła, które powstało. W miarę jak razem stajecie się silniejsi, tak też umacniają się więzi łączące was ze sobą.