Akademia Waldstein to instytut poświęcony studiom nad dyscyplinami paranormalnymi, znany tym samym jako Akademia Okultyzmu. Maya Kumashiro powraca do tego miejsca, aby wziąć udział w pogrzebie byłego dyrektora, Junichiro Kumashiro, swojego ojca. Maya, sceptyczka nienawidząca okultyzmu, spotyka Fumiakiego Uchidę, agenta czasu z przyszłości wysłanego do roku 1999, aby zapobiec apokaliptycznym Proroctwom Nostradamusa. Przepowiednie mówią, że szkoła będzie epicentrum kataklizmu, który zniszczy świat. Muszą połączyć siły, aby odkryć nie tylko to, co faktycznie doprowadziło do śmierci jej ojca, ale także, w ograniczonym czasie, znaleźć klucz, który uruchomi początek końca.