W roku L.C. 922 ludzkość staje w obliczu bezprecedensowego kryzysu. Po zakończeniu stuletniej wojny na mitycznym świecie Tetraheaven, pokonani Majinowie szukali bezpiecznego schronienia i najechali ludzki świat Septpię. Rząd jest zmuszony do walki, zatrudniając Logistyków należących do ALCA, specjalnej policji, która chroni ulice przed obcymi z innego świata. Logistycy otrzymują specjalną moc, która pozwala im wejść w trans z Boginiami z innego świata. Pewnego dnia Yoshichika Tsurugi, cywil, któremu brakuje "Logiki" i który żyje spokojnie z rodziną, spotyka piękną boginię Atenę, pomagając ludziom uciec przed atakiem Majina. Ona włada "Logiką", której Yoshichika powinien był utracić. To prowadzi Yoshichikę do nieoczekiwanego przeznaczenia z Ateną. Przyszłość świata zależy od "Szczęścia" i "Logiki" tych Logistyków.