Fabuła koncentruje się na Natsuru Senō, zwykłym chłopaku z niebieskimi włosami. Pewnego dnia budzi się i odkrywa, że zamienił się w dziewczynę. Pluszowy tygrys "Harakiri Tora" ożywa i informuje go, że został wybrany jako jeden z "Kämpfer", żeńskich wojowników. Kämpfer są przeznaczeni do walki z innymi Kämpfer. Historia zaczyna się, gdy zostaje zaatakowany przez nieznaną dziewczynę, która również jest Kämpfer.